PRJNA1471715：Homo sapiens 临床转录组或基因表达数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1471715

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自特发性肺纤维化（IPF）患者及年龄匹配对照肺组织的原代人肺成纤维细胞的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，这些细胞在标准体外培养条件下使用三种分离方案进行扩增：组织块爬出法、全肺细胞悬液（WLCS）法和阴性组分法。基于液滴的scRNA-seq（10x Genomics Chromium）对多个传代进行 profiling，鉴定出七种转录上不同的成纤维细胞亚型。差异基因表达和通路富集分析揭示了广泛的培养诱导的ECM产生和增殖性转录适应，同时部分保留了亚型特异性程序。该数据集为研究体外培养对人肺成纤维细胞异质性及IPF中疾病相关间充质状态的转录影响提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。