PRJNA1453409：无局部抗原感染早期上呼吸道效应与驻留记忆前体T细胞转录谱差异

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1453409

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为研究发育中上呼吸道（URT）效应记忆（TEM）和组织驻留记忆（TRM）T细胞的转录程序，我们用A/HKx31流感病毒腹腔感染野生型小鼠，并在感染后12天处理鼻腔组织。通过活体标记和表面标志物（CD127、KLRG1、CD69、CD103）鉴定出流感特异性记忆前体TRM和TEM，并分选进行批量RNA测序。对差异表达基因的分析以及利用公开数据集进行的靶向基因集富集分析显示，这两个亚群均上调了与真正的组织驻留记忆或效应记忆特征相关的基因，表明在缺乏局部抗原的情况下，其他环境信号线索可能协调了这些转录上截然不同的URT亚群的发育。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。