PRJNA1389641：黏液阻塞性肺疾病呈现独特缺氧与炎症气道上皮基因通路
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1389641），主题为转录组或基因表达，聚焦黏液阻塞性肺疾病。数据用于研究该疾病中气道上皮在缺氧与炎症条件下呈现的独特基因表达通路，可支持呼吸系统疾病相关的基因表达分析与机制探索（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
PRJNA1389641：黏液阻塞性肺疾病呈现独特缺氧与炎症气道上皮基因通路
PRJNA1389641 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物研究项目记录，其标题为“Muco-Obstructive Lung Disease Exhibits Distinct Hypoxic and Inflammatory Airway Epithelial Gene Pathways”，即黏液阻塞性肺疾病表现出独特的缺氧与炎症气道上皮基因通路。该数据集的主题标签为转录组或基因表达，属于呼吸系统疾病分类下的研究资源。项目聚焦于黏液阻塞性肺疾病中气道上皮在缺氧与炎症条件下所呈现的独特基因表达通路，可用于支持呼吸系统疾病相关的基因表达分析与机制探索。作为一个 BioProject 记录，它为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型及其相关链接。
【数据集背景】
BioProject 是 NCBI 提供的一种项目记录机制，用于汇集与单一研究计划相关的生物学数据，这些计划通常来自单一机构或某个联合体。一个 BioProject 记录的价值在于为用户提供单一入口，便于发现该项目所生成的各种数据类型。本数据集对应的项目围绕黏液阻塞性肺疾病展开，关注该疾病中气道上皮在缺氧与炎症条件下的基因表达特征，属于呼吸系统疾病研究范畴，主题归类为转录组或基因表达。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容与转录组或基因表达相关。项目标题进一步说明，研究关注黏液阻塞性肺疾病中气道上皮在缺氧与炎症条件下表现出的独特基因通路。因此，数据集所涉及的数据类型应围绕基因表达谱及其通路层面的分析结果。关于具体的样本数量、测序平台、数据文件格式与规模等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目 ID 为 1389641。BioProject 记录本身是相关生物学数据的集合入口，指向由单一机构或联合体发起的单一研究计划所生成的数据。关于样本采集地点、采集时间、受试对象来源及具体实验设计等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病相关的基因表达分析与机制探索，尤其是针对黏液阻塞性肺疾病中气道上皮在缺氧与炎症条件下基因通路变化的研究。研究者可借助该 BioProject 记录定位项目所关联的转录组或基因表达数据，用于通路层面的比较分析、候选基因筛选及疾病机制探讨。关于其他具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1389641）作为统一入口，查找该项目所生成的各种数据类型及其链接。由于 BioProject 记录汇集了与单一研究计划相关的生物学数据，使用者可据此导航至项目关联的数据资源。关于具体的数据下载方式、分析流程或软件工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 项目记录，其描述强调记录作为数据查找入口的功能。关于数据质量评估指标、样本量、技术偏差及使用限制等具体信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1389641
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
腔内阻塞导致慢性气道上皮缺氧。我们在人支气管上皮（HBE）培养物和切除的人支气管扩张肺组织中研究了慢性气道上皮缺氧与炎症刺激如何相互作用，从而产生黏液阻塞性疾病所特有的病变上皮环境。HBE培养物暴露于常氧或缺氧（1% O₂）条件下4天，同时用囊性纤维化（CF）肺来源的黏液脓性物质上清液（SMM）或PBS处理5天。进行了批量RNA测序。结果：无论处理顺序如何，缺氧和SMM在很大程度上调控各自独立的转录程序。PTGS2（COX2）和CCL20代表了一小部分被缺氧和SMM共同叠加上调的基因。结论：慢性缺氧和炎症调控不同的基因/通路，二者共同作用在黏液阻塞气道中形成复杂的病变环境。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
