肺移植小鼠单细胞RNA测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1225245

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自小鼠肺移植模型的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据。该研究探讨了成纤维细胞激活蛋白（FAP）作为慢性肺移植物功能障碍（CLAD）早期生物标志物的表达情况。在移植前基线、移植后第7天和第28天收集肺样本，以分析与纤维化重塑相关的基因表达模式。该数据集为了解CLAD进展过程中肺移植物内的细胞异质性和动态变化提供了见解。总体设计：将C57BL/6小鼠肺原位移植到C57BL/10受体中。在三个时间点收集肺组织：基线（静息状态）、移植后第7天和第28天。制备单细胞悬液并使用10x Genomics平台进行处理。原始测序数据使用Cell Ranger处理，随后使用Seurat进行聚类、UMAP可视化和差异基因表达分析。该实验设计允许对CLAD发展过程中的基因表达变化进行时间性评估。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。