PRJNA1225237：探索成纤维细胞活化蛋白作为慢性肺移植物功能障碍早期生物标志物

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1225237

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自人肺移植受者的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据。从CLAD患者和供体收集肺组织样本，以评估细胞异质性和基因表达动态。总体设计：从诊断为慢性肺移植物功能障碍（CLAD）的人肺移植受者和供体获取肺组织样本。从这些组织制备单细胞悬液，并使用10x Genomics Chromium平台进行处理。原始测序数据使用Cell Ranger处理，随后使用Seurat进行聚类、UMAP可视化和差异基因表达分析。该实验设计允许对CLAD组和对照组之间的基因表达谱进行比较分析。由于担心提交个人可识别序列数据进行开放获取，人类/患者样本的原始文件未提交至GEO。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。