基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1178086：急性肺损伤后募集肺泡巨噬细胞产生Activin-A加重肺纤维化

该数据集来自 NCBI，英文名称为 PRJNA1178086: Activin-A production by recruited alveolar macrophages exacerbates pulmonary fibrosis following acute lung injury，主题为转录组或基因表达，聚焦急性肺损伤后肺纤维化过程中募集肺泡巨噬细胞产生 Activin-A 的作用。数据集围绕急性呼吸窘迫综合征（ARDS）及其向损伤后肺纤维化进展的病理过程展开，涉及脂多糖（LPS）诱导的急性肺损伤（ALI）小鼠模型中肺泡巨噬细胞（AM）谱的变化，以及主要募集肺泡巨噬细胞（recAMs）所产生 Activin-A 在损伤后肺纤维化处理中的作用。本站将其归类为呼吸系统疾病 / 其他。以下依据可获得的信息对该数据集作分段介绍。

【数据集背景】

急性呼吸窘迫综合征（ARDS）是过度肺部炎症与肺泡上皮细胞凋亡构成的复杂病理级联过程，可导致呼吸功能障碍和衰竭。部分 ARDS 可进展为更严重的肺纤维化状态，即损伤后肺纤维化。当 ARDS 导致持续的肺泡和间质纤维化时，其死亡率和发生率尤其高，需要紧急治疗和适当管理。脂多糖（LPS）诱导的急性肺损伤（ALI）小鼠模型已被广泛用于研究人类 ARDS。该数据集所对应的研究在此类小鼠模型中观察到肺泡巨噬细胞（AM）谱的改变，并特别关注主要募集的肺泡巨噬细胞（recAMs）所产生的 Activin-A 与损伤后肺纤维化处理之间的关联。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。源站描述提及研究采用 ALI 模型并观察肺泡巨噬细胞谱的变化，但未提供样本数量、测序平台、基因列表、表达矩阵或具体分析结果等细节。除主题标签所指示的转录组或基因表达数据外，源站未提供更具体的数据类型、文件组成或数据规模信息。

【采集与来源】

数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述显示研究使用脂多糖（LPS）诱导的急性肺损伤（ALI）小鼠模型，用于研究人类 ARDS，并在此模型中观察肺泡巨噬细胞（AM）谱的改变。源站描述在方法部分以“Methods: ALI a”截断，未提供完整的实验设计、样本采集流程、测序或检测方法、动物分组及时间点等信息，因此这些内容源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是围绕急性肺损伤后肺纤维化、肺泡巨噬细胞谱变化以及募集肺泡巨噬细胞产生 Activin-A 这一主题的分析。其背景涉及 ARDS 向损伤后肺纤维化进展的病理过程，以及 LPS 诱导 ALI 小鼠模型在 ARDS 研究中的应用。更具体的适用分析类型、可支持的比较研究或验证用途，源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法，包括数据下载方式、预处理步骤、分析流程或软件工具等信息。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估、数据完整性、批次效应、样本量或技术偏倚等质量与限制相关信息。源站描述在方法部分不完整，可能影响对实验设计和数据范围的完整理解。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式或许可信息。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE280364

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1178086

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：急性呼吸窘迫综合征（ARDS）是一个复杂的病理级联过程，涉及过度的肺部炎症和肺泡上皮细胞凋亡，导致呼吸功能障碍和衰竭。部分ARDS可进展为更严重的肺纤维化状态，称为损伤后肺纤维化。当ARDS导致持续的肺泡和间质纤维化时，其死亡率和发病率尤其高，需要紧急治疗和适当管理。脂多糖（LPS）诱导的急性肺损伤（ALI）小鼠模型已被广泛用于研究人类ARDS。在此，我们发现在该小鼠模型中肺泡巨噬细胞（AM）谱发生了改变。具体而言，由优势募集的AMs（recAMs）产生的激活素-A被发现与损伤后肺纤维化的进程有关。方法：通过气管内给予3.5mg/kg LPS在C57BL/6小鼠中建立ALI动物模型。采用单细胞RNA（scRNA）测序对肺巨噬细胞进行详细分类和功能表征。

体内实验中，我们利用ELISA（酶联免疫吸附试验）、组织学染色方法和免疫荧光，在ALI小鼠模型中评估了激活素A在损伤后肺纤维化中的作用。体外实验中，我们利用蛋白质印迹（WB）、qPCR（定量实时PCR）、RNA-seq（RNA测序）和免疫荧光，分析了激活素A对MLE-12细胞和骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）的影响。结果：我们的研究结果显示，在ALI情况下，recAMs取代组织驻留肺泡巨噬细胞（TRAMs）成为优势巨噬细胞群体。GO（基因本体论）分析结果表明，激活素A与伤口愈合及SMAD（ mothers against decapentaplegic抑制因子）蛋白信号通路相关。免疫荧光结果显示，激活素A的受体主要定位于肺泡

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别