PRJNA1172724：多组学分析揭示儿童与成人脓毒症免疫图谱 [bulk RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1172724

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症被定义为由宿主对感染反应失调引起的危及生命的器官功能障碍。免疫反应因感染的解剖来源不同而存在显著差异。本研究利用bulk RNA测序技术，探讨与脓毒症相关的转录组图谱。共分析了207份PBMC样本，包括来自健康成人、成人ICU对照、成人脓毒症患者、健康儿童、儿科ICU对照和儿科脓毒症患者的样本。对该数据集的分析揭示了共有及来源特异性的基因表达模式，为理解脓毒症的分子机制提供了见解，并为靶向治疗策略的开发提供了依据。总体设计：从健康对照、ICU对照和脓毒症患者血液样本中分离的PBMC提取总RNA。脓毒症患者根据感染来源的解剖部位进行分类，包括腹部、呼吸道、泌尿道、皮肤和中枢神经系统（CNS）。进行bulk RNA测序以捕获全局基因表达谱。

原始测序数据已上传至中国基因组序列档案库，登录号为GSA:HRA008452。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。