PRJNA1148142:衰老对机械通气期间肺部细胞反应的影响

该数据集来自 NCBI,主题为衰老对机械通气期间肺部细胞反应的影响。研究对年轻和老年雄性小鼠实施机械通气,评估表面活性剂功能、炎症和血管通透性的变化,并利用单细胞 RNA 测序刻画细胞特异性转录变化

sra
浏览 7
基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1148142: Impact of aging on pulmonary cellular responses during mechanical ventilation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1148142:衰老对机械通气期间肺部细胞反应的影响

PRJNA1148142 数据集来自 NCBI,主题为衰老对机械通气期间肺部细胞反应的影响。研究对年轻和老年雄性小鼠实施机械通气,评估表面活性剂功能、炎症和血管通透性的变化,并利用单细胞 RNA 测序刻画细胞特异性转录变化。该数据集归类于呼吸系统疾病 / 其他,主题标签为转录组或基因表达。其背景涉及急性呼吸窘迫综合征(ARDS)在老年人群中高发病率与高死亡率,以及机械通气作为支持治疗在维持气体交换的同时可能加重损伤的问题。研究结果显示,老年小鼠表面活性剂功能障碍加重、炎症反应反而较轻、血管通透性显著增加,差异基因表达与通路分析还揭示了老年内皮细胞的转录特征。该数据集适合用于探索衰老与机械通气交互作用下的肺部细胞特异性转录变化及相关病理生理机制。

【数据集背景】

急性呼吸窘迫综合征(ARDS)可导致显著的发病率与死亡率,尤其在老年人群中更为突出。机械通气是 ARDS 常用的支持治疗手段,对于维持气体交换是必要的,但也可能传播或加重损伤。基于这一临床问题,研究提出假设:衰老会加剧机械通气引起的病理生理反应。为验证该假设,研究采用年轻与老年雄性小鼠进行机械通气实验,并从表面活性剂功能、炎症和血管通透性等维度进行评估,同时借助单细胞 RNA 测序解析细胞特异性的转录变化。该数据集即围绕这一研究背景产生,主题标签为转录组或基因表达,归属于呼吸系统疾病 / 其他分类。

【数据内容】

该数据集的核心内容是单细胞 RNA 测序所获得的转录组或基因表达数据,用于刻画机械通气条件下年轻与老年雄性小鼠肺部的细胞特异性转录变化。研究同时评估了表面活性剂功能、炎症和血管通透性的变化,这些表型评估与单细胞转录组数据共同构成对衰老影响机械通气肺部细胞反应的多层面描述。差异基因表达与通路分析揭示了老年内皮细胞的转录特征。除上述主题与描述外,源站未提供关于样本数量、测序平台、数据文件格式与规模的详细信息。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov。研究对象的采集与实验设置为:对年轻和老年雄性小鼠实施机械通气,并评估表面活性剂功能、炎症和血管通透性的变化;同时利用单细胞 RNA 测序 delineate 细胞特异性转录变化。关于具体的动物品系、通气参数、样本处理流程与测序建库细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病相关研究,尤其是围绕 ARDS、机械通气相关肺损伤与衰老交互作用的探索。其单细胞转录组内容可用于分析机械通气期间肺部细胞类型特异性的基因表达变化,结合研究中关于表面活性剂功能障碍、炎症反应与血管通透性的表型观察,支持对衰老相关病理生理机制的进一步研究。主题标签为转录组或基因表达,也使其可用于基因表达与通路层面的比较分析。其他具体应用场景源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法、数据处理流程或分析指南。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、覆盖度、批次效应或技术限制的说明。就研究描述而言,实验对象为年轻与老年雄性小鼠,结果涉及表面活性剂功能障碍在老年小鼠中加重、炎症在老年动物中较轻以及血管通透性随衰老显著增加等发现;这些结论的适用范围与推广性需结合源站未提供的完整方法学信息加以判断。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1148142

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性呼吸窘迫综合征(ARDS)导致显著的发病率和死亡率,尤其是在老年人群中。机械通气是ARDS常见的支持性治疗手段,对于维持气体交换是必要的,但也可能加重损伤。我们假设衰老会加剧对机械通气的病理生理反应。我们对年轻和老年雄性小鼠进行机械通气,并评估了表面活性剂功能、炎症和血管通透性的变化。此外,采用单细胞RNA测序来描绘细胞特异性转录变化。结果显示,老年小鼠的表面活性剂功能障碍加重,而炎症在老年动物中较不明显。此外,血管通透性随衰老显著增加。差异基因表达和通路分析揭示,老年内皮细胞表现出细胞间连接形成的改变,老年小鼠的肺泡巨噬细胞显示出减弱的炎症反应。

这些结果凸显了衰老与机械通气之间复杂的相互作用,包括因细胞间连接形成改变和炎症减轻(可能源于免疫耗竭)而导致的与年龄相关的内皮屏障功能障碍易感性。研究结论认为,与年龄相关的血管变化可能是老年患者在机械通气过程中损伤易感性增加的基础。总体设计:对暴露于机械通气3小时的年轻(2-3月龄)和老龄(22月龄)小鼠肺组织细胞的mRNA图谱进行分析(每组使用3只动物并合并在一起)。mRNA图谱通过单细胞测序使用Illumina NextSeq 500测序仪生成。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案