CLEC5A缺陷小鼠CLP诱导多微生物脓毒症肺部单细胞转录组
该数据集为CLEC5A缺陷小鼠在盲肠结扎穿刺（CLP）诱导多微生物脓毒症后的肺部单细胞转录组数据，来源于NCBI。数据通过scRNA-seq生成，覆盖CLEC5A-/-小鼠肺组织，可用于探索CLEC5A在脓毒症诱导肺损伤中的细胞与分子机制，并支持基因表达分析与细胞类型分类研究（来源 ncbi.nlm
基本信息
资源简介
CLEC5A缺陷小鼠CLP诱导多微生物脓毒症肺部单细胞转录组
PRJNA1050824 数据集聚焦于 CLEC5A 缺陷小鼠在盲肠结扎穿刺（CLP）诱导多微生物脓毒症后的肺部单细胞转录组。脓毒症是由宿主对感染反应失调引起、可导致多器官衰竭的危重病症，而肺是脓毒症相关损伤的主要受累器官之一，严重脓毒症患者发生急性肺损伤（ALI）和急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的风险很高。CLEC5A 是一种参与宿主抗感染防御的模式识别受体，阻断 CLEC5A 可提高多微生物脓毒症或内毒素血症小鼠的存活率并保护肺部免受脓毒感染。该数据集通过 scRNA-seq 生成 CLEC5A-/- 小鼠肺部的单细胞转录组，用于探索 CLEC5A 在脓毒症诱导肺损伤中的细胞与分子机制，支持基因表达分析与细胞类型分类研究，数据来源于 NCBI。
【数据集背景】
脓毒症是威胁生命的病症，由宿主对感染反应失调引起多器官衰竭。在易受感染的器官中，肺是导致脓毒症的主要器官之一。严重脓毒症患者发生急性肺损伤（ALI）和急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的风险较高，后者在多达 50% 的患者中出现。髓系 C 型凝集素结构域家族 5 成员 A（CLEC5A）是一种模式识别受体，参与宿主抗感染防御。阻断 CLEC5A 可提高多微生物脓毒症或内毒素血症小鼠的存活率，并保护肺部免受脓毒感染。为探索 CLEC5A 在脓毒症诱导肺损伤中的细胞与分子机制，研究者采用 scRNA-seq 生成了 CLEC5A-/- 小鼠肺部的综合性单细胞转录组数据，小鼠接受盲肠结扎穿刺（CLP）处理以诱导多微生物脓毒症。
【数据内容】
该数据集为单细胞转录组数据，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。数据覆盖 CLEC5A-/- 小鼠肺组织，来源于经 CLP 诱导多微生物脓毒症的小鼠模型。数据可用于基因表达分析与细胞类型分类研究，以刻画肺组织中的细胞组成与转录特征。样本数量、细胞数量、测序深度、基因数目等具体指标源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名称为 PRJNA1050824: Single-cell transcriptomics in the lungs of CLEC5A-deficient mice with CLP-induced polymicrobial sepsis。数据通过 scRNA-seq 技术生成，生物样本为 CLEC5A-/- 小鼠肺组织，小鼠经盲肠结扎穿刺（CLP）诱导多微生物脓毒症。本站分类为呼吸系统疾病 / 其他。更详细的采样时间点、重复设置与建库平台信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于探索 CLEC5A 在脓毒症诱导肺损伤中的细胞与分子机制，支持肺组织基因表达分析、细胞类型分类与细胞组成刻画等研究。由于数据来自 CLEC5A 缺陷小鼠的脓毒症模型，可用于比较分析 CLEC5A 缺失背景下肺部单细胞转录特征，为理解脓毒症相关急性肺损伤的细胞机制提供数据基础。具体分析方向与结论需结合研究设计自行判断，源站未提供预设分析结果。
【使用方法】
使用者可基于 scRNA-seq 数据开展基因表达分析与细胞类型分类研究，围绕 CLEC5A-/- 小鼠肺组织在 CLP 诱导多微生物脓毒症后的转录特征进行探索。数据的具体下载方式、文件格式、处理流程与分析工具源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 CLEC5A-/- 小鼠在 CLP 诱导多微生物脓毒症模型下的肺部单细胞转录组数据，模型与基因型具有特异性，结论外推到其他物种、其他脓毒症模型或野生型背景时需谨慎。样本量、细胞质量指标、批次信息与验证情况源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1050824
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
脓毒症是一种危及生命的疾病，由宿主对感染反应失调引起多器官衰竭。在易受感染的不同器官中，肺是导致脓毒症的主要器官4。严重脓毒症患者发生急性肺损伤（ALI）和急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的风险很高，发生率高达50%。髓系C型凝集素结构域家族5成员A（CLEC5A）是一种模式识别受体，参与宿主防御感染。阻断CLEC5A可提高多微生物脓毒症或内毒素血症小鼠的存活率，并保护肺部免受脓毒症感染。为探究CLEC5A在脓毒症诱导肺损伤中的潜在细胞和分子机制，通过scRNA-seq生成了CLEC5A-/-肺部的全面单细胞转录组学数据。对小鼠进行盲肠结扎穿刺（CLP），术后12小时收集肺组织。从三只CLEC5A-/-小鼠和三只WT同窝小鼠的肺组织制备单细胞悬液，并将这些小鼠的混合细胞使用10×Genomics Chromium系统进行scRNA-seq处理。
去除多细胞聚集体并过滤低质量细胞后，共获得55,177个单细胞，其中29,306个细胞来自WT肺组织，15,871个细胞来自CLEC5A-/-肺组织。通过均匀流形近似与投影（Uniform Manifold Approximation and Projection），总细胞被分为34个不同的簇，共鉴定出14种不同的细胞类型，包括粒细胞、T细胞、B细胞、肺泡巨噬细胞（AM）、单核细胞、巨噬细胞、自然杀伤T细胞（NKT）、间皮细胞、自然杀伤细胞（NK）、内皮细胞、成纤维细胞、树突状细胞（DC）、上皮细胞和平滑肌细胞（SMC）。scRNA-seq分析提示CLEC5A在内皮细胞中与脓毒症肺内免疫细胞串扰方面可能发挥作用。CLEC5A的缺失抑制了脓毒症诱导的内皮屏障功能障碍
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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