PRJNA1026869：急性肺损伤小鼠模型中AT2特异性敲除SLC39A1

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1026869

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性肺损伤（ALI）是一种常见的严重呼吸系统综合征，全球每年新增ARDS患者近300万。目前ALI尚无明确有效的治疗方法。在病理生理过程中，介导靶细胞锌离子含量变化的锌离子转运体差异很大，并发挥截然不同的生物学效应。我们鉴定了ALI中的关键锌离子转运体，发现SLC39A1可能在ALI期间转运锌离子过程中发挥重要作用，并介导AT2细胞的锌摄取。总体设计：为探究锌离子转运体SLC39A1在ALI中的作用，我们构建了他莫昔芬诱导的AT2特异性SLC39A1敲除小鼠（Slc9a1 icKO），并用脂多糖刺激当日完成造模。随后，我们利用对照组和敲除小鼠处理与未处理的4组肺组织RNA-seq数据进行了基因表达谱分析。对Control+vehicle、Control+LPS、icKO+vehicle、icKO+LPS的RNA-seq数据进行比较基因表达谱分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。