PRJNA1023493：单细胞RNA测序揭示实验性疟疾相关急性呼吸窘迫综合征中的内皮细胞杀伤与消退通路

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1023493

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数据说明

疟原虫引起疟疾，这是一种全球性健康疾病，每年导致超过2亿临床病例和60万例死亡。大多数死亡由各种并发症引起，包括疟疾相关急性呼吸窘迫综合征（MA-ARDS）。尽管抗疟药物能非常快速高效地杀灭疟原虫，但仍有15%的复杂型疟疾患者死亡。这凸显了研究疟原虫被杀死后这些并发症恢复过程中所涉及的消退机制的重要性。为研究MA-ARDS的消退，对感染伯氏疟原虫NK65株的C57BL/6小鼠在症状出现后给予抗疟药物治疗，结果存活率达80%。微型计算机断层扫描显示感染后肺部形态发生改变，因水肿导致总肺容积和非通气肺容积增加。全身体积描记法证实肺通气发生显著改变，并在消退过程中得以恢复。

单细胞RNA测序表明，感染后肺部炎症状态加剧，同时内皮细胞急剧减少，这与CD8+ T细胞介导的杀伤作用一致。在消退过程中，抗炎通路上调，并观察到内皮细胞增殖。MultiNicheNet相互作用组分析提供了大量可能参与疾病消退的通路，这些通路可能值得进行功能验证。总之，促进限制炎症的促消退通路以及促进内皮细胞增殖，可能是设计辅助治疗以促进抗疟药物杀灭疟原虫后消退的一种有趣策略。总体设计：从感染对照组小鼠（CON）、未治疗、感染PbNK65的C57BL/6小鼠感染后第8天（d8）解剖以及ART+CQ治疗、感染PbNK65的C57BL/6小鼠第12天解剖的肺部分离细胞

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。