慢性阻塞性肺疾病与支气管扩张症宿主-微生物组相互作用的多组学研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05738044

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：慢性阻塞性肺疾病急性加重、支气管扩张伴急性加重。慢性阻塞性肺疾病和支气管扩张是中国常见的慢性呼吸系统疾病。慢性阻塞性肺疾病以气道炎症、肺气肿和肺泡破坏导致不可逆的肺功能下降为特征。支气管扩张以永久性支气管扩张为特征，其主要临床症状为咳嗽、呼吸困难、咯血和反复呼吸道感染。支气管扩张的发病率和患病率在全球呈持续增长趋势。气道微生物群的变化在支气管扩张的发生和发展中起重要作用，其与宿主细胞及微环境中多种生物和非生物因素相互作用，形成复杂的生态系统。此外，越来越多的证据表明，气道微生物组与慢性阻塞性肺疾病表型和内型相关，且菌群失调促进气道炎症。然而，由于对微生物功能特性、代谢活动以及与宿主免疫系统相互作用的了解有限，其机制仍知之甚少。

研究人员旨在从中国七家临床中心收集COPD和支气管扩张患者的痰标本，并进行多组学分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。