合并肺纤维化与肺气肿患者肺组织炎症特征数据集
该数据集来自 doi.org，配套论文发表于 Biomarkers（2018），包含 3 个补充文件，围绕合并肺纤维化与肺气肿（CPFE）患者肺组织的炎症特征
基本信息
资源简介
合并肺纤维化与肺气肿患者肺组织炎症特征数据集
Inflammatory signature in lung tissues in patients with combined pulmonary fibrosis and emphysema
该数据集来自 doi.org，配套论文发表于 Biomarkers（2018），包含 3 个补充文件，围绕合并肺纤维化与肺气肿（CPFE）患者肺组织的炎症特征。研究获取肺气肿、IPF、CPFE 及正常受试者的离体肺组织制备提取物，检测 34 种炎症蛋白，发现 IPF 与 CPFE 组织蛋白水平几乎无差异，肺气肿组织炎症谱与二者不同，且蛋白水平与病变组织严重程度无关。数据可用于呼吸系统疾病炎症机制研究与生物标志物探索（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Inflammatory signature in lung tissues in patients with combined pulmonary fibrosis and emphysema》发表于 Biomarkers（2018），DOI：10.1080/1354750X.2018.1542458。项目资助方：Supported by grants from the National Institutes of Health [DA040619, DA14230, DA25532, and P30DA13429].。源站首次发布：2019-11-26。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景：合并肺纤维化与肺气肿（CPFE）的病因学和炎症特征目前仍不确定。目的：我们旨在检查一组肺气肿、间质性肺纤维化（IPF）和 CPFE 患者肺组织中炎症蛋白的水平。材料与方法：从肺气肿、IPF、CPFE（或正常受试者）受试者获取离体肺，制备组织提取物。在每个组织切片中测量 34 种炎症蛋白。结果：与 CPFE 组织相比，IPF 中所有 34 种蛋白的水平几乎无法区分，并且总体而言，肺气肿组织中的炎症谱与 IPF 和 CPFE 不同。此外，炎症蛋白水平与病变组织水平的严重程度无关。结论：我们发现肺气肿肺组织具有
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个，合计 289.50 KB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.11171330.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Physical Sciences not elsewhere classified、Medicine、Cell Biology、Genetics、Physiology。主题标签：Emphysema、IPF、CPFE、inflammatory protein、chronic inflammation。本站分类：呼吸系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Physical Sciences not elsewhere classified、Medicine、Cell Biology、Genetics、Physiology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Inflammatory_signature_in_lung_tissues_in_patients_with_combined_pulmonary_fibrosis_and_emphysema/11171330
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Inflammatory signature in lung tissues in patients with combined pulmonary fibrosis and emphysema. Taylor & Francis. Cornwell, William D.; Kim, Cynthia; Lastra, Alejandra C.; Dass, Chandra; Bolla, Sudhir; Wang, He; et al
【使用注意】
· 源站最后修改于 2024-02-12，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.11171330
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 289.5 KB。
数据说明
背景：目前，联合肺纤维化与肺气肿（CPFE）的病因学及炎症特征仍不明确。目的：我们旨在研究一组肺气肿、间质性肺纤维化（IPF）及CPFE患者肺组织中炎症蛋白的水平。材料与方法：从肺气肿、IPF、CPFE（或正常受试者）个体获取移植肺，并制备组织提取物。在每个组织切片中检测了34种炎症蛋白。结果：与CPFE组织相比，IPF中所有34种蛋白的水平几乎无法区分，总体而言，肺气肿组织中的炎症特征与IPF和CPFE不同。此外，炎症蛋白水平与病变组织程度的严重性无关。结论：我们发现肺气肿肺组织与IPF或CPFE相比具有独特的炎症特征。然而，CPFE肺部的炎症特征与IPF患者的肺部基本相同。
这些数据表明，与IPF和CPFE相比，不同的炎症过程共同促进了肺气肿患者的疾病进程。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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