NCBI GEO 的 GSE34789 原始数据层
机械通气诱导的肺损伤可导致 ARDS 等严重状况,这些状况与高死亡率相关(约 30%,Stapleton 等,Chest,2005)

基本信息
资源简介
NCBI GEO 的 GSE34789 原始数据层
GSE34789 Raw Data Layer from NCBI GEO 是一个面向呼吸系统疾病研究领域的基因表达数据集,收录于本站“呼吸系统疾病 / 其他”分类之下,原始来源为 synapse.org。该数据集围绕机械通气诱导的肺损伤这一研究主题展开,其背景假设是:机械通气所致肺损伤可进一步引发急性呼吸窘迫综合征(ARDS)等严重临床状况,而这类状况与较高的死亡率相关,据 Stapleton 等发表于 Chest(2005)的文献,死亡率约为 30%。数据集旨在通过不同基因表达水平的变化,为理解上述病理过程提供原始数据层面的支持。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。
【数据集背景】
机械通气是重症监护中维持呼吸功能的重要手段,但不当或过度的通气策略本身可能造成肺组织损伤,即机械通气诱导的肺损伤。这种损伤可进展为急性呼吸窘迫综合征等严重状况,临床预后较差。源站描述指出,此类状况与高死亡率相关,约为 30%,并引用了 Stapleton 等人发表于 Chest(2005)的研究作为依据。基于这一临床问题,相关研究提出的假设是:不同基因的表达水平变化能够为揭示机械通气诱导肺损伤的发生机制提供线索。该数据集正是这一研究方向下的原始数据层资源,服务于对上述假设的检验与探索。
【数据内容】
该数据集为原始数据层(Raw Data Layer),来源于 NCBI GEO 的 GSE34789 系列,并经 synapse.org 提供获取。其内容定位于基因表达层面的原始数据,用于支撑对不同基因表达水平变化的分析。关于具体的样本数量、分组设计、检测平台、基因数量、文件格式与文件体积等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据集的原始出处为 NCBI GEO 的 GSE34789 系列,当前收录来源站为 synapse.org。源站描述中提及了研究背景与假设,但未提供样本采集方式、实验处理条件、测序或芯片平台信息、采集时间与地点等具体内容,源站未提供。
【适用场景】
结合其主题与分类,该数据集适用于呼吸系统疾病相关研究,尤其是机械通气诱导肺损伤及急性呼吸窘迫综合征方向的基因表达分析,可用于探索不同基因表达水平变化与肺损伤病理过程之间的关联。关于具体的适用分析类型、可支持的建模任务或验证用途,源站未提供。
【使用方法】
该数据集以原始数据层形式提供,使用时应以其原始数据属性为前提开展后续处理与分析。关于数据下载方式、预处理步骤、标准化流程、分析工具与参数设置等具体操作说明,源站未提供。
【质量与限制】
数据集来源于 NCBI GEO 的公开系列并经 synapse.org 提供,其原始数据层定位意味着使用者需自行完成后续处理。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、样本量充足性以及使用中的其他限制,源站未提供。
【引用与许可】
源站描述中引用了 Stapleton 等人发表于 Chest(2005)的文献,用于说明相关状况的死亡率背景。关于该数据集本身的正式引用格式、作者信息、发表文献以及许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
需登录公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://synapse.org/Synapse:syn257814
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
呼吸机相关性肺损伤可导致如ARDS等严重状况,其与高死亡率相关(约30%,Stapleton等,《胸科》,2005年)。我们假设不同基因表达水平的变化会引导我们找到
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