烟曲霉ZnfA锌指转录因子与钙代谢及卡泊芬净耐受相关数据集
该数据集来自NCBI GEO,包含烟曲霉ZnfA转录因子的ChIP-seq基因组结合/占据谱数据,用于研究ZnfA在钙代谢和卡泊芬净耐受中的作用

基本信息
资源简介
烟曲霉ZnfA锌指转录因子与钙代谢及卡泊芬净耐受相关数据集
Aspergillus fumigatus ZnfA, a novel zinc finger transcription factor involved in calcium metabolism and caspofungin tolerance
该数据集来自NCBI GEO,包含烟曲霉ZnfA转录因子的ChIP-seq基因组结合/占据谱数据,用于研究ZnfA在钙代谢和卡泊芬净耐受中的作用。数据覆盖烟曲霉对高浓度卡泊芬净响应中ZnfA调控铁稳态和细胞壁组织的靶点信息,可支持真菌耐药机制、转录调控网络及抗真菌药物耐受相关研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 26 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):侵袭性肺曲霉病(IPA)是一种危及生命的真菌感染,尤其多见于免疫受损人群。抗真菌药物可及性低,加之耐药性的出现,已成为重要的临床关切。卡泊芬净(CSP)被推荐为二线治疗,但已有耐药和耐受机制的报道。然而,真菌细胞如何协调对CSP的响应尚不完全清楚。在本研究中,我们表征了ZnfA,这是先前筛选研究中鉴定的一种新转录因子(TF),参与烟曲霉的钙和CSP响应。通过染色质免疫沉淀结合DNA测序(ChIP-seq)分析揭示,该TF在响应高CSP浓度时对铁稳态和细胞壁组织发挥重要作用。此外,ZnfA与关键T协同作用
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL23160、746128。本站分类:呼吸系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167847
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 27 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
侵袭性肺曲霉病(IPA)是一种危及生命的真菌感染,尤其在免疫功能低下人群中更为突出。抗真菌药物可及性低,加之抗真菌耐药性的出现,已成为重要的临床关切。卡泊芬净(CSP)被推荐为二线治疗,但已有耐药和耐受机制的报道。然而,真菌细胞如何协调对CSP的应答尚未完全阐明。在本研究中,我们对ZnfA进行了表征——这是既往筛选研究中鉴定的一种新型转录因子(TF),参与钙及烟曲霉对CSP的应答。通过染色质免疫沉淀结合DNA测序(ChIP-seq)分析揭示,该TF在高浓度CSP应答中对铁稳态和细胞壁组织发挥重要作用。此外,ZnfA与关键TF CrzA协同作用,参与对钙、细胞壁及渗透胁迫的应答。因此,本研究增进了我们对钙信号与CSP细胞应答之间联系的认识,并揭示了烟曲霉中调控胁迫感知的不同通路之间的复杂关联。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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