GSE143601：通过靶向失调产孢途径降低烟曲霉毒力

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE143601

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

免疫受损宿主吸入机会性霉菌烟曲霉（Aspergillus fumigatus）的分生孢子可导致侵袭性肺部疾病。逃逸免疫防御的吸入分生孢子萌发形成丝状菌丝，侵入肺组织。在人类宿主的侵袭性感染过程中，产孢现象罕见发生，使得真菌的大部分能量得以导向营养生长。我们假设，在感染期间强制诱导产孢能够抑制烟曲霉的营养生长，削弱该微生物致病的能力。为研究产孢途径失调对烟曲霉毒力的影响，我们将产孢的关键转录调控因子（brlA）置于多西环素诱导型启动子的控制下表达。在体外和体内，均观察到brlA过表达对多西环素呈现出时间和剂量依赖性响应。在体外营养生长条件下，将可诱导的brlA过表达菌株暴露于低剂量多西环素可诱导产孢，而高剂量则阻止生长。brlA的过表达在无脊椎动物和小鼠侵袭性曲霉病模型中均减弱了烟曲霉的毒力。

RNA测序研究和表型分析显示，brlA过表达导致细胞信号传导、氨基酸和碳水化合物代谢发生改变，包括海藻糖生物合成的显著上调和多糖毒力因子半乳糖氨基半乳聚糖生物合成的下调。这项概念验证研究表明，激活烟曲霉中的分生孢子形成途径可以降低毒力，并提示诱导brlA的小分子有望成为治疗烟曲霉感染的一类新型疗法。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。