NCBI GEO 来源的 GSE10474 原始数据层

急性呼吸窘迫综合征(ARDS)/急性肺损伤(ALI)在 30 年前就已被描述,但参与该综合征的特定基因集合之间的相互作用仍未完全被理解

synapse
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基因组分类呼吸系统疾病ARDSALI基因表达疾病状态分析
GSE10474 Raw Data Layer from NCBI GEO

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-12

资源简介

NCBI GEO 来源的 GSE10474 原始数据层

GSE10474 Raw Data Layer from NCBI GEO 是一个与呼吸系统疾病相关的数据集,在本站分类中归属于呼吸系统疾病下的“其他”类别。该数据集来源于 synapse.org,其原始描述指向急性呼吸窘迫综合征(ARDS)与急性肺损伤(ALI)这一研究方向。根据源站描述,ARDS/ALI 在约三十年前就已被提出和描述,但围绕该综合征,特定基因集合之间如何相互作用,至今仍未得到完全理解。该数据集以“疾病状态分析”为关键词,属于 NCBI GEO 的原始数据层,适合作为探索 ARDS/ALI 相关基因表达与疾病状态关系的原始数据资源。

【数据集背景】

急性呼吸窘迫综合征(ARDS)和急性肺损伤(ALI)是呼吸系统疾病领域的重要研究对象。源站描述指出,这类综合征早在约三十年前就已被描述,说明其临床与病理认识已有较长历史。然而,尽管人们早已知道该综合征的存在,参与其中的特定基因集合之间的相互作用仍然没有被完全理解。这一背景构成了该数据集的核心问题意识:研究者希望借助基因层面的数据,进一步分析疾病状态与基因集合之间的关系。数据集以“疾病状态分析”为关键词,表明其设计目的与疾病状态下的分子特征分析相关。

【数据内容】

该数据集为 NCBI GEO 的原始数据层,英文名称为 GSE10474 Raw Data Layer from NCBI GEO。本站将其归入呼吸系统疾病 / 其他类别。源站描述中强调的关键词为“disease state analysis”,即疾病状态分析。围绕 ARDS/ALI,数据集所关注的是参与该综合征的特定基因集合及其相互作用。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、平台类型、基因数量、具体检测指标或数据文件格式的进一步说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 synapse.org,并标注为 NCBI GEO 的原始数据层。源站描述提到 ARDS/ALI 已被描述约三十年,但特定基因集合之间的相互作用仍未完全被理解。除来源站和来源数据库层级外,源站未提供关于采集时间、采集地点、受试者来源、样本处理流程或实验设计的具体信息。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集适用于与急性呼吸窘迫综合征(ARDS)/急性肺损伤(ALI)相关的疾病状态分析,尤其是围绕特定基因集合之间相互作用的研究场景。其关键词“disease state analysis”表明,该数据可用于分析疾病状态下的分子特征。由于本站分类为呼吸系统疾病 / 其他,它也可能适合呼吸系统疾病领域内更广泛的探索性分析。除这些方向外,源站未提供更具体的适用场景说明。

【使用方法】

该数据集为 NCBI GEO 的原始数据层,来源于 synapse.org。源站未提供关于数据下载方式、预处理步骤、分析流程、软件工具或参数设置的具体说明。因此,使用方法需结合源站提供的原始数据层信息进一步确认,源站未提供可直接引用的操作指南。

【质量与限制】

源站描述指出,ARDS/ALI 虽已被描述约三十年,但参与该综合征的特定基因集合之间的相互作用仍未完全被理解。这提示该数据集所面对的科学问题本身仍具有未决性。关于数据质量、样本量、批次效应、缺失值、平台偏倚或验证情况,源站未提供相关信息。因此,无法依据现有信息对该数据集的质量与限制做出进一步判断。

【引用与许可】

该数据集来源于 synapse.org,并标注为 NCBI GEO 的原始数据层。除来源信息外,源站未提供关于引用方式、许可协议、使用限制或授权条件的说明。如需引用或使用,应进一步查阅源站的相关规定。

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源站:https://synapse.org/Synapse:syn235403

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性呼吸窘迫综合征(ARDS)/急性肺损伤(ALI)在30年前就被描述,但参与该综合征的特定基因集之间的相互作用仍未被完全理解。关键词:疾病状态分析

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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