ARDSNet与iSPAAR联盟中ALI的遗传风险

数据集获取

源站：https://doi.org/10.60645/bdc-12q7-4279

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数据说明

这项GWAS子研究phs000686包含了来自phs000631研究中可获取受试者的基因型和选定表型。关于“ARDSnet与iSPAAR联盟：遗传学研究”研究参与者的汇总级表型，可在顶级研究页面phs000631 ARDSNet iSPAAR队列查看。所有ARDSnet及“iSPAAR联盟：遗传学研究”顶级研究及其子研究的个体级表型数据和分子数据，可通过申请“ARDSnet与iSPAAR联盟：遗传学研究”phs000631研究的授权访问获取。本研究的主要目标是识别改变个体发展为急性呼吸窘迫综合征(ARDS)/急性肺损伤(ALI)风险的遗传因素，该病症特征为严重的肺部炎症、无法维持足够的氧合水平及高死亡率。我们采用了全基因组关联研究(GWAS)，对比了一组ARDS患者(n=1072)与一组有发展成ARDS风险的危重患者(n=1124)。

样本和表型信息取自现有队列，这些队列作为iSPAAR（鉴定易感ALI风险改变的SNP）联盟的一部分而组建，该联盟是由NHLBI资助的多机构研究（RC2 HL101779），专注于鉴定ALI及相关结局的遗传风险。iSPAAR中确诊的ALI病例包括来自在麻省总医院入组的急性呼吸窘迫分子流行病学（MEA）研究[1]的受试者，以及来自ARDSNet联盟（http://www.ardsnet.org/）的受试者，后者是由NHLBI资助的临床研究网络，在ARDS中开展随机临床试验。我们采用了来自ARDSNet液体与导管治疗试验（FACTT）[2]、EDEN-OMEGA研究[3,4]以及沙丁胺醇治疗ALI（ALTA）研究[5]的ARDS病例。Con

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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