NTM 支气管扩张肺部微生物组评估

该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦非结核分枝杆菌(NTM)肺部疾病与支气管扩张人群的气道微生物组评估

NYU Langone HealthNYU Langone Health
clinicaltrials
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其他分类Nontuberculous MycobacteriaBronchiectasis
Evaluation Of The Lung Microbiome In NTM Bronchiectasis

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

NTM 支气管扩张肺部微生物组评估

该数据集英文名为 Evaluation Of The Lung Microbiome In NTM Bronchiectasis,来源于 clinicaltrials.gov,主题聚焦非结核分枝杆菌(NTM)肺部疾病与支气管扩张人群的气道微生物组评估。其研究设计为生物标志物队列研究,旨在探讨特定气道微生物群改变是否与肺部非结核分枝杆菌疾病相关。研究对象为疑似患有肺部 NTM 疾病的受试者,计划纳入 200 名受试者,并利用诱导痰标本及上气道样本评估气道微生物组。由于诱导痰可能反映上、下气道的不同区域,研究还将在亚组(病例对照)中分别通过上气道采样和支气管镜检查获取样本,评估上气道与下气道微生物组。该数据集在站内分类为呼吸系统疾病 / 其他,主题标签包括 Nontuberculous Mycobacteria 与 Bronchiectasis。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究关注非结核分枝杆菌(NTM)肺部疾病与支气管扩张。研究提出生物标志物队列研究设计,用于研究特定气道微生物群改变是否与肺部 NTM 疾病相关。研究对象为疑似患有肺部 NTM 疾病的受试者,计划纳入 200 名受试者。研究将评估气道微生物组,并关注诱导痰可能反映上、下气道不同区域这一问题,因此在亚组中进一步区分上气道与下气道微生物组。以上背景信息来自源站描述,未提供更多关于疾病负担、流行病学或机制假设的细节。

【数据内容】

数据集围绕气道微生物组评估展开,涉及诱导痰标本和上气道样本。研究计划在 200 名疑似肺部 NTM 疾病的受试者中,使用诱导痰的一份等分样本及上气道样本评估气道微生物组。由于诱导痰可能反映上气道或下气道的不同区域,研究还将在病例对照亚组中,分别通过上气道采样和支气管镜检查获取样本,以评估上气道与下气道微生物组。主题标签包括 Nontuberculous Mycobacteria 和 Bronchiectasis。除上述内容外,源站未提供关于具体微生物组检测方法、测序平台、生物信息学流程、变量列表或结果指标的信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 clinicaltrials.gov。源站描述显示,研究采用生物标志物队列设计,计划纳入 200 名疑似患有肺部 NTM 疾病的受试者。样本类型包括诱导痰标本和上气道样本;在亚组(病例对照)中,还通过上气道采样和支气管镜检查分别获取样本,用于评估上气道与下气道微生物组。除这些信息外,源站未提供关于采集时间点、采集地点、样本处理、运输或存储条件的具体说明。

【适用场景】

该数据集适用于关注非结核分枝杆菌肺部疾病与支气管扩张人群气道微生物组的研究场景。其设计可用于探讨特定气道微生物群改变是否与肺部 NTM 疾病相关,并可用于区分上气道与下气道微生物组的评估。由于涉及诱导痰、上气道样本以及亚组中的支气管镜采样,该数据集可能适用于需要比较不同气道区域微生物组的研究。除上述用途外,源站未提供关于具体分析目标、统计方法或验证用途的信息。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括访问方式、下载格式、数据结构、字段说明、分析脚本或配套工具。该数据集来源于 clinicaltrials.gov,相关研究信息以源站描述为准。若需使用,应参考源站提供的原始记录与相关研究方案。除上述内容外,源站未提供关于数据获取权限、使用步骤或技术文档的信息。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性、准确性、偏倚控制或验证结果的信息。已知研究计划纳入 200 名疑似肺部 NTM 疾病的受试者,并采用诱导痰、上气道样本以及亚组中的支气管镜采样。由于诱导痰可能反映上、下气道不同区域,研究在亚组中区分上气道与下气道微生物组,但源站未提供样本量分配、缺失数据、混杂因素或局限性讨论。除上述内容外,源站未提供关于质量评估或限制条件的进一步说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可条款、使用协议或版权信息。该数据集来源于 clinicaltrials.gov,英文名为 Evaluation Of The Lung Microbiome In NTM Bronchiectasis。除上述内容外,源站未提供关于引用要求或许可范围的说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT02779478

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:非结核分枝杆菌、支气管扩张。拟采用生物标志物队列研究设计,探讨特定气道微生物群改变是否与肺部非结核分枝杆菌(NTM)病相关。在200名疑似患有肺部NTM病的受试者队列中,研究者将利用诱导痰和上气道样本的等分试样评估气道微生物组。由于诱导痰可能反映上/下气道的不同区域,研究者将在一个亚组(病例对照组的患者)中,分别使用通过上气道采样和支气管镜检查获得的样本,评估上气道和下气道微生物组。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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