支气管扩张急性加重期上呼吸道感染痰病原谱与临床结局前瞻性队列研究数据

该数据集来自一项前瞻性队列研究,聚焦支气管扩张急性加重期上呼吸道感染的痰病原谱与临床结局,同时源站描述涉及纤维化间质性肺病患者1年进展风险的临床、影像与血液生物标志物评估

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2023-06-20 更新
浏览 10
医学影像预测traction bronchiectasishoneycombingmonocyte countforced vital capacity (FVC)diffusion capacity (DL)idiopathic pulmonary fibrosisautoimmune diseaselung fibrosis
Data from: Sputum pathogen spectrum and clinical outcomes of upper respiratory tract infection in bronchiectasis exacerbation: a prospective cohort study

基本信息

模态
医学影像
大小
0.000015064 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-20
版本
v1

资源简介

支气管扩张急性加重期上呼吸道感染痰病原谱与临床结局前瞻性队列研究数据

Table_1_Clinical, imaging, and blood biomarkers to assess 1-year progression risk in fibrotic interstitial lung diseases—Development and validation of the honeycombing, traction bronchiectasis, and monocyte (HTM)-score.docx

该数据集来自一项前瞻性队列研究,聚焦支气管扩张急性加重期上呼吸道感染的痰病原谱与临床结局,同时源站描述涉及纤维化间质性肺病患者1年进展风险的临床、影像与血液生物标志物评估。数据包含基线特征、CT半定量评估及外周血指标,可用于构建和验证纤维化ILD患者1年疾病进展的预测模型,也可用于探索支气管扩张急性加重期感染与结局的关联(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Tocilizumab Prevents Progression of Early Systemic Sclerosis–Associated Interstitial Lung Disease》发表于 Arthritis & Rheumatology(2021),DOI:10.1002/art.41668。源站首次发布:2022-11-16。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):引言:纤维化间质性肺病(ILD)的进展导致肺功能不可逆丧失和死亡率增加。基于一家机构的ILD登记库,我们旨在评估源自基线患者特征、计算机断层扫描(CT)和外周血的生物标志物对纤维化ILD患者疾病进展的预后价值。方法:在登记的209例连续ILD委员会患者中,142例有完整随访信息,并根据标准化半定量CT评估(在0-6个定义肺野中增加典型ILD表现)存在网状影或蜂窝影定义为纤维化ILD。1年进展定义为用力肺活量相对下降≥10%、一氧化碳弥散能力相对下降≥15%、死亡或肺移植。三分之二的患者被随机分配到推导队列

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 15.06 KB。数据集 DOI:10.3389/fmed.2022.1043720.s003。

【主题与分类】

源站学科分类:Radiology and Organ Imaging、Foetal Development and Medicine、Obstetrics and Gynaecology、Primary Health Care、Medical and Health Sciences not elsewhere classified、Dermatology。主题标签:traction bronchiectasis、honeycombing、monocyte count、forced vital capacity (FVC)、diffusion capacity (DL)、idiopathic pulmonary fibrosis、autoimmune disease、lung fibrosis。本站分类:呼吸系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Radiology and Organ Imaging、Foetal Development and Medicine、Obstetrics and Gynaecology、Primary Health Care、Medical and Health Sciences not elsewhere classified、Dermatology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Clinical_imaging_and_blood_biomarkers_to_assess_1-year_progression_risk_in_fibrotic_interstitial_lung_diseases_Development_and_validation_of_the_honeycombing_traction_bronchiectasis_and_monocyte_HTM_-score_docx/21562485

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Shao, Guangyu; Hawle, Patricia; Akbari, Kaveh; Horner, Andreas; Hintenberger, Rainer; Kaiser, Bernhard; et al. (2022). Table_1_Clinical, imaging, and blood biomarkers to assess 1-year progression risk in fibrotic interstitial lung diseases—Development and validation of the honeycombing, traction bro…

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-20,引用时请注意版本时效。

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命令行下载

curl -L -o "Table_1_Clinical, imaging, and blood biomarkers to assess 1-year progression risk in fibrotic interstitial lung diseases—Development and validation of.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/38223495"

文件清单

  • Table_1_Clinical, imaging, and blood biomarkers to assess 1-year progression risk in fibrotic interstitial lung diseases—Development and validation of.docx(15.06 KB)

文件总体积 15.06 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

引言:纤维化间质性肺疾病(ILD)的进展会导致肺功能不可逆丧失和死亡率增加。基于一个机构性ILD登记数据库,我们旨在评估源自基线患者特征、计算机断层扫描(CT)和外周血的生物标志物对纤维化ILD患者疾病进展的预后价值。方法:在登记的209例连续ILD委员会患者中,142例具有完整随访信息,并根据标准化半定量CT评估中是否存在网状影或蜂窝影被归类为纤维化ILD,该评估在0-6个定义肺野中累加典型ILD表现。1年时的进展定义为用力肺活量相对下降≥10%、一氧化碳弥散量相对下降≥15%、死亡或肺移植。三分之二的患者被随机分配至推导队列,评估年龄、性别、基线肺功能、CT表现评分和血液生物标志物对疾病进展的影响。显著变量被纳入回归模型,其结果用于推导进展风险评分,随后将该评分应用于验证队列。

结果在推导队列中,年龄、单核细胞计数≥0.65 G/L、蜂窝影及牵拉性支气管扩张范围具有显著影响。多因素分析显示,单核细胞计数≥0.65 G/L(1分)以及蜂窝影或牵拉性支气管扩张联合评分[0分 vs. 1–4个肺野(1分)vs. 5–6个肺野(2分)]为显著变量,因此用于评分模型的构建。在推导队列中,所得评分0、1、2和3分对应的1年进展率分别为20%、25%、46.9%和88.9%。同样,在验证队列中,1年进展率分别为0%、23.8%、53.9%和62.5%。评分≥2分的敏感度为70.6%,特异度为67.9%,评分模型的受试者工作特征分析曲线下面积为71.7%。结论蜂窝影和牵拉性支气管扩张的范围以及血单核细胞计数升高可预测纤维化ILD患者1年内的进展。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fmed.2022.1043720.s003(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Clinical_imaging_and_blood_biomarkers_to_assess_1-year_progression_risk_in_fibrotic_interstitial_lung_diseases_Development_and_validation_of_the_honeycombing_traction_bronchiectasis_and_monocyte_HTM_-score_docx/21562485)。

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