GOLD 1 期慢性阻塞性肺疾病患者的聚类分析

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Cluster Analysis in Patients with GOLD 1 Chronic Obstructive Pulmonary Disease
• DOI：10.1371/journal.pone.0123626
• 发布日期：2015-04-23
• 文件数：3 个
• 文件总体积：2.00 MB
• 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Cluster_Analysis_in_Patients_with_GOLD_1_Chronic_Obstructive_Pulmonary_Disease_/1392302

命令行下载

curl -L -o "S1_Dataset.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/2036957"
curl -L -o "S1_Protocol.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/2036958"
curl -L -o "S2_Protocol.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/2036959"

文件清单

• S1_Dataset.xls（322.56 KB）
• S1_Protocol.pdf（497.87 KB）
• S2_Protocol.pdf（1.18 MB）

文件总体积 2.00 MB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景
我们假设在慢性阻塞性肺疾病全球倡议(GOLD)1级肺功能分类中存在异质性，并且在该GOLD分类内可以识别出不同的亚组。方法
来自两项临床试验的随机化前研究参与者包括有症状/无症状的GOLD 1级慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者和健康对照者。采用层次聚类分析，利用随机化前的人口统计学资料、症状评分、肺功能、峰值运动反应和日常体力活动水平来推导人群亚组。结果
GOLD 1级COPD患者在临床变量方面存在相当大的异质性。除第1秒用力呼气容积(FEV1)/用力肺活量(FVC)外，所有参数在GOLD 1级COPD与对照组之间均有相当大的重叠。识别出三个聚类：聚类I(18例[15%]COPD患者；105例[85%]对照者)；聚类II(45例[80%]COPD患者；11例[20%]对照者)；聚类III(22例[92%]COPD患者；2例[8%]对照者)。

除了一氧化碳弥散量降低和基线呼吸困难指数低于对照组外，聚类I的COPD患者在肺容积、运动能力和体力活动水平方面均保持良好。与聚类I的COPD患者相比，聚类II的COPD患者有更高的吸烟史和更严重的气体陷闭。与对照组及聚类I和II的COPD患者相比，聚类III的COPD患者体力活动减少，且其FEV1/FVC低于聚类I和II的COPD患者。结论
这些结果强调了GOLD 1期COPD内部的异质性，支持对患者采取个体化的治疗策略。试验注册
www.clinicaltrials.gov。NCT01360788和NCT01072396。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0123626（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Cluster_Analysis_in_Patients_with_GOLD_1_Chronic_Obstructive_Pulmonary_Disease_/1392302）。