Eeyou Istchee地区间质性肺病居民特征:总体及按亚型分层

数据描述Eeyou Istchee地区间质性肺病(Definite ILD)居民的总体特征及按亚型分层的结果。源站描述显示,研究对比了晚期IPF与SSc-ILD患者及器官供者对照的21例离体肺组织单细胞RNA测序,发现干扰素信号通路差异及共享的异常基底样细胞

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2023-06-01 更新
浏览 2
时间序列分类systemic sclerosissystemic sclerosis (scleroderma)idiopathic pulmonary fibrosisinterstitial lung disease (ILD)single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq)
Characteristics of Eeyou Istchee residents with interstitial lung disease (‘Definite ILD’), overall and stratified by subtype.

基本信息

模态
时间序列
大小
0.000963072 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

Eeyou Istchee地区间质性肺病居民特征:总体及按亚型分层

Table_2_Disparate Interferon Signaling and Shared Aberrant Basaloid Cells in Single-Cell Profiling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis and Systemic Sclerosis-Associated Interstitial Lung Disease.xls

该数据集来自figshare,包含一份Excel表格,对应2021年发表于Frontiers in Immunology的论文补充材料。数据描述Eeyou Istchee地区间质性肺病(Definite ILD)居民的总体特征及按亚型分层的结果。源站描述显示,研究对比了晚期IPF与SSc-ILD患者及器官供者对照的21例离体肺组织单细胞RNA测序,发现干扰素信号通路差异及共享的异常基底样细胞。该数据可用于呼吸系统疾病尤其是间质性肺病的亚型特征分析与单细胞转录组研究参考(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Review: Interstitial Lung Disease Associated With Systemic Sclerosis and Idiopathic Pulmonary Fibrosis: How Similar and Distinct?》发表于 Arthritis & Rheumatology(2014),DOI:10.1002/art.38702。源站首次发布:2021-03-30。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):特发性肺纤维化(IPF)与系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)在受累患者的主要人口学特征和已识别的遗传风险等位基因上存在差异,但两种疾病都常进展为呼吸衰竭和死亡。将晚期SSc-ILD与IPF进行对比,有助于了解免疫失调在肺纤维化中可能发挥的作用。为分析IPF与SSc-ILD之间细胞类型特异性转录组的共性与差异,我们比较了来自晚期IPF、SSc-ILD患者及器官供者对照的21例离体肺组织的单细胞RNA测序(scRNA-seq)。IPF与SSc-ILD组织的比较揭示了不同的干扰素信号模式,其中干扰素-γ信号在IPF的SPP1hi和FABP4hi巨噬细胞、细胞毒性T细胞及自然杀伤细胞中上调,而I型干扰

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 963.07 KB。数据集 DOI:10.3389/fimmu.2021.595811.s004。

【主题与分类】

源站学科分类:Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。主题标签:systemic sclerosis、systemic sclerosis (scleroderma)、idiopathic pulmonary fibrosis、interstitial lung disease (ILD)、single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq)。本站分类:呼吸系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_2_Disparate_Interferon_Signaling_and_Shared_Aberrant_Basaloid_Cells_in_Single-Cell_Profiling_of_Idiopathic_Pulmonary_Fibrosis_and_Systemic_Sclerosis-Associated_Interstitial_Lung_Disease_xls/14338205

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Valenzi, Eleanor; Tabib, Tracy; Papazoglou, Anna; Sembrat, John; Bittar, Humberto E. Trejo; Rojas, Mauricio; et al. (2021). Table_2_Disparate Interferon Signaling and Shared Aberrant Basaloid Cells in Single-Cell Profiling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis and Systemic Sclerosis-Associated Interstiti…

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_2_Disparate Interferon Signaling and Shared Aberrant Basaloid Cells in Single-Cell Profiling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis and Systemic Scler.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/27357218"

文件清单

  • Table_2_Disparate Interferon Signaling and Shared Aberrant Basaloid Cells in Single-Cell Profiling of Idiopathic Pulmonary Fibrosis and Systemic Scler.xls(963.07 KB)

文件总体积 963.07 KB(源站 API 实测)。

数据说明

特发性肺纤维化(IPF)与系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)在受累患者的主要人口学特征及已识别的遗传风险等位基因方面存在差异,但两种疾病均常进展为呼吸衰竭和死亡。将晚期SSc-ILD与IPF进行对比,有助于深入了解免疫失调在肺纤维化中可能发挥的作用。为分析IPF与SSc-ILD之间细胞类型特异性转录组的共性与差异,我们比较了来自晚期IPF、SSc-ILD患者及器官供者对照的21份离体肺组织标本的单细胞RNA测序(scRNA-seq)。IPF与SSc-ILD组织的比较揭示了干扰素信号传导的不同模式:在IPF的SPP1hi和FABP4hi巨噬细胞、细胞毒性T细胞及自然杀伤细胞中,干扰素-γ信号传导上调;而在相应的SSc-ILD细胞群中,I型干扰素信号传导及其产生上调。浆细胞样树突状细胞仅见于患病肺组织,且与IPF相比,SSc-ILD中该类细胞表现出细胞应激通路的上调。

在IPF和SSc-ILD中,肺泡I型细胞均显著减少,且这些细胞具有可区分疾病的独特转录组特征。首次在SSc-ILD中鉴定出KRT5-/KRT17+异常基底样细胞,其表现出细胞衰老和上皮-间质转化的标志物。总之,我们的研究利用scRNA-seq的强大能力,识别了IPF与SSc-ILD之间的关键差异细胞类型和通路,为特发性和自身免疫性间质性肺病之间共享和独特的机制提供了新见解。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fimmu.2021.595811.s004(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_2_Disparate_Interferon_Signaling_and_Shared_Aberrant_Basaloid_Cells_in_Single-Cell_Profiling_of_Idiopathic_Pulmonary_Fibrosis_and_Systemic_Sclerosis-Associated_Interstitial_Lung_Disease_xls/14338205)。

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