肺结节病中六种RNA结合蛋白表达谱及肾活检患者特征数据集

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Expression Profile of Six RNA-Binding Proteins in Pulmonary Sarcoidosis
• DOI：10.1371/journal.pone.0161669
• 发布日期：2016-08-30
• 文件数：5 个
• 文件总体积：247.30 KB
• 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Expression_Profile_of_Six_RNA-Binding_Proteins_in_Pulmonary_Sarcoidosis/3797271

命令行下载

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curl -L -o "S1 Table.DOC" "https://ndownloader.figshare.com/files/5912100"
curl -L -o "S2 Table.DOC" "https://ndownloader.figshare.com/files/5912109"
curl -L -o "S3 Table.DOC" "https://ndownloader.figshare.com/files/5912115"
curl -L -o "S4 Table.DOC" "https://ndownloader.figshare.com/files/5912118"

文件清单

• S1 File.DOC（35.33 KB）
• S1 Table.DOC（56.83 KB）
• S2 Table.DOC（73.22 KB）
• S3 Table.DOC（40.96 KB）
• S4 Table.DOC（40.96 KB）

文件总体积 247.30 KB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景
结节病的特征在于细胞因子和趋化因子配体/受体以及蛋白水解酶的上调。这种促炎特征在转录后水平受RNA结合蛋白（RBPs）调控。我们研究了六种RBPs（AUF1、HuR、NCL、TIA、TIAR、PCBP2）和两种蛋白水解酶抑制剂（RECK、PTEN）在肺结节病中的体内表达，并将其与四个对照组（健康个体以及患有其他呼吸系统疾病的患者：慢性阻塞性肺疾病（COPD）、哮喘和特发性间质性肺炎（IIPs））中的表达进行了比较。方法
采用RT-PCR对取自50例结节病患者、23例健康对照、30例COPD患者、19例哮喘患者和19例IIPs患者的支气管肺泡（BA）细胞中的mRNA进行定量。采用流式细胞术评估取自9例结节病患者和6例健康对照的外周血T淋巴细胞（PBTLs）中AUF1和HuR的细胞内蛋白表达。

结果
考虑到多重比较的严格条件，我们在纳入所有患者（无论吸烟状态）的主要分析以及随后仅限于从不吸烟者的亚组分析中一致观察到，AUF1（p≤0.02）和HuR（p≤0.03）蛋白的BA mRNA表达高于对照健康PBTLs。结论
与健康个体相比，我们结节病患者的BA细胞中三种RBP（AUF1、TIA和NCL）的mRNA表达及其编码RECK的潜在靶mRNA，以及PBTLs中AUF1和HuR的蛋白表达均下调。其意义，例如对编码促炎因子的mRNA稳定性的影响，应在结节病中进一步探索。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0161669（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Expression_Profile_of_Six_RNA-Binding_Proteins_in_Pulmonary_Sarcoidosis/3797271）。