猫、犬及人类侵袭性曲霉病新发病原Aspergillus felis数据集
源站描述涉及一项评估mNGS区分曲霉感染与定植价值的研究，分析了感染组（n=36）与定植组（n=32）在曲霉丰度、患者特征、抗生素调整及肺部微生物群方面的差异
基本信息
资源简介
猫、犬及人类侵袭性曲霉病新发病原Aspergillus felis数据集
DataSheet_1_Clinical performance of metagenomic next-generation sequencing for diagnosis of pulmonary Aspergillus infection and colonization.xlsx
该数据集来自frontiersin.figshare.com，包含1个Excel文件，主题为猫、犬及人类侵袭性曲霉病的新发病原Aspergillus felis。源站描述涉及一项评估mNGS区分曲霉感染与定植价值的研究，分析了感染组（n=36）与定植组（n=32）在曲霉丰度、患者特征、抗生素调整及肺部微生物群方面的差异。数据可用于探索mNGS在鉴别曲霉感染与定植中的表现，以及相关临床特征差异（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Metagenomic next-generation sequencing for the diagnosis of pulmonary aspergillosis in non-neutropenic patients: a retrospective study》发表于 Frontiers in Cellular and Infection Microbiology（2022），DOI：10.3389/fcimb.2022.925982。源站首次发布：2024-03-28。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景：目前评估宏基因组下一代测序（mNGS）在区分曲霉感染与定植方面价值的研究尚不充分。方法：分析了mNGS在区分曲霉感染与定植中的表现，以及患者特征、抗生素调整和肺部微生物群的差异。结果：曲霉感染患者（n=36）与定植患者（n=32）之间的曲霉丰度存在显著差异（P BALF mNGS是区分曲霉定植与感染的有价值工具。在曲霉感染与定植患者之间，可观察到患者年龄、住院时间、血红蛋白、咳嗽和胸闷的差异。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 20.56 KB。数据集 DOI：10.3389/fcimb.2024.1345706.s001。
【主题与分类】
源站学科分类：Medical Bacteriology、Medical Infection Agents (incl. Prions)、Medical Virology、Clinical Microbiology。主题标签：pulmonary aspergillosis、Aspergillus、colonization、metagenomic next-generation sequencing、optimal threshold value。本站分类：呼吸系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medical Bacteriology、Medical Infection Agents (incl. Prions)、Medical Virology、Clinical Microbiology。
【获取与许可】
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Clinical_performance_of_metagenomic_next-generation_sequencing_for_diagnosis_of_pulmonary_Aspergillus_infection_and_colonization_xlsx/25494493
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Jiang, Ziwei; Gai, Wei; Zhang, Xiaojing; Zheng, Yafeng; Jin, Xuru; Han, Zhiqiang; et al. (2024). DataSheet_1_Clinical performance of metagenomic next-generation sequencing for diagnosis of pulmonary Aspergillus infection and colonization.xlsx. Frontiers. Dataset
下载信息
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：DataSheet_1_Clinical performance of metagenomic next-generation sequencing for diagnosis of pulmonary Aspergillus infection and colonization.xlsx
- DOI：10.3389/fcimb.2024.1345706.s001
- 发布日期：2024-03-28
- 文件数：1 个
- 文件总体积：20.56 KB
- 源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Clinical_performance_of_metagenomic_next-generation_sequencing_for_diagnosis_of_pulmonary_Aspergillus_infection_and_colonization_xlsx/25494493
命令行下载
curl -L -o "DataSheet_1_Clinical performance of metagenomic next-generation sequencing for diagnosis of pulmonary Aspergillus infection and colonization.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/45325489"
文件清单
DataSheet_1_Clinical performance of metagenomic next-generation sequencing for diagnosis of pulmonary Aspergillus infection and colonization.xlsx（20.56 KB）
文件总体积 20.56 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
背景目前，评估宏基因组二代测序（mNGS）在区分曲霉感染与定植方面价值的研究尚不充分。
方法分析了mNGS在区分曲霉感染与定植中的表现，以及患者特征、抗生素调整和肺部微生物群方面的差异。
结果曲霉感染患者（n=36）与定植患者（n=32）之间曲霉丰度存在显著差异（P 支气管肺泡灌洗液mNGS是区分曲霉定植与感染的有价值工具。曲霉感染与定植患者在年龄、住院时间、血红蛋白、咳嗽和胸闷方面存在可观察到的差异。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fcimb.2024.1345706.s001（source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet_1_Clinical_performance_of_metagenomic_next-generation_sequencing_for_diagnosis_of_pulmonary_Aspergillus_infection_and_colonization_xlsx/25494493）。
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