HIV相关肺气肿肺泡巨噬细胞蛋白质组学数据集
该数据集来自clinicaltrials.gov,聚焦HIV相关肺气肿在HAART时代的自然史研究。数据覆盖HIV血清阳性吸烟伴肺气肿者、HIV阳性吸烟不伴肺气肿者及HIV阴性吸烟者的肺泡巨噬细胞蛋白质组比较,并涉及HIV与丙型肝炎共感染是否导致肺功能加速下降

基本信息
资源简介
HIV相关肺气肿肺泡巨噬细胞蛋白质组学数据集
该数据集英文名为 Alveolar Macrophage Proteomics in HIV-associated Emphysema,在站内归入呼吸系统疾病 / 其他分类,来源为 clinicaltrials.gov。其研究主题聚焦于 HAART 时代 HIV 相关肺气肿的自然史,并以肺泡巨噬细胞蛋白质组为核心比较对象,涉及 HIV 血清阳性吸烟伴肺气肿者、HIV 阳性吸烟不伴肺气肿者以及 HIV 阴性吸烟者三类人群;同时关注 HIV 与丙型肝炎共感染是否会导致以用力呼气量和一氧化碳弥散能力下降为表现的肺部疾病加速进展。主题标签包括 HIV、Emphysema 与 HIV Infections。
【数据集背景】
该数据集来源于 clinicaltrials.gov,所对应的研究条件包括 HIV、Emphysema 与 HIV Infections。研究背景指向 HAART 时代的 HIV 相关肺气肿自然史,即在这一治疗背景下刻画 HIV 相关肺气肿的发生与发展过程。研究还提出两个相互关联的科学问题:其一,比较 HIV 血清阳性吸烟伴肺气肿者与 HIV 阳性吸烟不伴肺气肿者、HIV 阴性吸烟者的肺泡巨噬细胞蛋白质组;其二,判断 HIV 与丙型肝炎共感染是否会造成肺部疾病加速,并以用力呼气量和一氧化碳弥散能力的下降作为表现。上述背景信息构成了该数据集围绕 HIV 感染、吸烟与肺气肿之间关系展开蛋白质组层面比较的基本框架。
【数据内容】
数据集的核心内容为肺泡巨噬细胞蛋白质组数据,用于在三类人群之间进行比较:HIV 血清阳性吸烟伴肺气肿者、HIV 阳性吸烟不伴肺气肿者以及 HIV 阴性吸烟者。除蛋白质组比较外,数据集所对应的研究还涉及 HIV 与丙型肝炎共感染与肺功能指标之间的关系,相关肺功能表现包括用力呼气量和一氧化碳弥散能力的下降。主题标签为 HIV、Emphysema 与 HIV Infections。关于样本量、蛋白质组具体检测平台、鉴定到的蛋白质数量、肺功能指标的具体数值等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 clinicaltrials.gov,站内分类为呼吸系统疾病 / 其他。源站描述所列条件为 HIV、Emphysema 与 HIV Infections,并说明研究目的包括 delineate HIV associated emphysema 在 HAART 时代的自然史、比较上述三类人群的肺泡巨噬细胞蛋白质组,以及确立 HIV 与丙型肝炎共感染是否导致以用力呼气量和一氧化碳弥散能力下降为表现的肺部疾病加速。关于具体的采集地点、采集时间跨度、样本处理流程与仪器参数,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕 HIV 相关肺气肿的蛋白质组层面比较研究,尤其是以肺泡巨噬细胞为对象、在吸烟人群中区分伴肺气肿与不伴肺气肿状态的分析场景;也适用于 HIV 感染与丙型肝炎共感染对肺功能影响这一问题的探索性研究,关注指标包括用力呼气量和一氧化碳弥散能力。此外,该数据集可用于 HAART 时代 HIV 相关肺气肿自然史相关研究背景下的对照设计参考,即按 HIV 血清状态与肺气肿状态划分人群进行比较。关于该数据集在其他疾病领域或非吸烟人群中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
依据源站描述,使用该数据集时可围绕三类人群的肺泡巨噬细胞蛋白质组开展组间比较,即以 HIV 血清阳性吸烟伴肺气肿者为观察组,分别与 HIV 阳性吸烟不伴肺气肿者及 HIV 阴性吸烟者进行对照分析;同时可结合 HIV 与丙型肝炎共感染状态,考察其与用力呼气量和一氧化碳弥散能力下降之间的关系。关于数据的具体格式、字段结构、访问方式与分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的信息来自 clinicaltrials.gov 的登记描述,研究聚焦于 HAART 时代 HIV 相关肺气肿的自然史,并以肺泡巨噬细胞蛋白质组比较为主要内容。由于源站未提供样本量、检测平台、数据完整性与质控指标等信息,难以据此评估数据规模与精度;关于数据是否存在缺失、批次效应或其他技术限制,源站未提供。使用时应以源站登记信息为准,并注意该数据集所覆盖的人群限定为吸烟者及上述 HIV 血清状态分组。
【引用与许可】
该数据集来源为 clinicaltrials.gov,站内分类为呼吸系统疾病 / 其他。关于引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00823927
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件:HIV、肺气肿、HIV感染。旨在描绘HAART时代HIV相关肺气肿的自然史。比较伴有肺气肿的HIV血清阳性吸烟者的肺泡巨噬细胞蛋白质组与无肺气肿的HIV+吸烟者及HIV-吸烟者的肺泡巨噬细胞蛋白质组。确定HIV与丙型肝炎共感染是否会导致肺部疾病加速,表现为用力呼气量和一氧化碳弥散能力下降。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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