COPD患者与非COPD者肺部真菌组纵向研究

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0b17c9eefe080eacf377934b07febd284ea1bb337db39f619fabe681943482d1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景 探讨肺真菌组稳定性的研究较少。我们报告了一项大规模支气管镜检查研究（MicroCOPD）中，伴和不伴COPD的参与者口腔和肺真菌组的纵向变化。方法 对30名伴COPD和21名不伴COPD的参与者进行重复采样。我们在两个时间点从每位参与者采集口腔冲洗液（OW）和支气管肺泡灌洗液（BAL）样本。对核糖体RNA基因簇的内部转录间隔区1进行PCR扩增，并在Illumina HiSeq测序仪上测序。比较两个时间点之间在分类学、α多样性和β多样性方面的差异，并检查了合并使用抗生素的影响。结果 样本对以念珠菌属为主。与口腔分类学相比，我们观察到肺分类学的稳定性较低，此外BAL中Yue-Clayton测度高于OW（0.69 vs 0.22）也强调了这一点。视觉上未见明显影响……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。