定量PCR细菌水平无法区分复发性UTI与其他非感染性泌尿症状

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源站：https://doi.org/10.7910/DVN/DRLS8H

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数据集大小约 175.1 KB。

数据说明

引言：包括定量聚合酶链反应（qPCR）在内的不依赖培养的分子技术在检测尿路病原体方面具有高敏感性。尽管qPCR正越来越多地应用于尿路感染（UTI）的诊断，但关于其区分UTI与非感染性泌尿系统症状（如尿失禁、尿频或尿急）准确性的数据仍然有限。本研究旨在评估qPCR在区分复发性UTI与无症状对照者及非感染性泌尿系统症状患者方面的效用。方法：采用qPCR技术，使用针对常见尿路病原体（如大肠埃希菌、肠球菌和克雷伯菌）、共生菌种（如乳杆菌）及白色念珠菌的微生物特异性引物，对502名伴有或不伴有泌尿生殖系统症状（包括尿失禁和复发性UTI（rUTI））的女性尿液DNA进行检测。设定严格的阈值以区分阳性与阴性结果。按年龄、绝经状态和诊断分层，通过逻辑回归分析比较阳性结果女性的比例。结果：所有女性中有18%可显著检测到尿液中的大肠埃希菌。

大肠杆菌占69%，肠球菌属占69%，肺炎克雷伯菌占50%，白色念珠菌占31%。没有qPCR检测阈值能够区分有症状的复发性尿路感染（rUTI）受试者与对照组或具有非感染性泌尿系统症状的患者。仅在复发性尿路感染受试者中观察到卷曲乳杆菌水平降低。按绝经状态分层后，与绝经前女性相比，绝经后女性的大肠杆菌（p=0.023）和肠球菌（p=0.002）水平更高，而乳杆菌（p<0.001）水平更低。结论：无症状女性和具有非感染性泌尿系统症状的女性通过qPCR检测显示的尿路病原体水平相似。对于不高度怀疑急性膀胱炎的女性，医疗服务提供者在使用不依赖培养的分子检测时应谨慎。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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