重症COVID-19肺炎期间的肺纤维化

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04987528

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数据说明

病症：严重急性呼吸综合征冠状病毒2型、急性呼吸窘迫综合征、肺纤维化。将回顾性收集2020年3月至2021年6月期间在马赛欧洲医院重症监护室(ICU)住院患者的医疗记录，使用电子数据库进行。收集的数据将侧重于人口统计学、临床变量、生物学分析、肺活检以及住院期间进行的胸部CT扫描。我们针对COVID-19管理的常规方案遵循“2019冠状病毒病(COVID-19)治疗指南”，包括早期使用皮质类固醇（地塞米松）和IL-6受体拮抗剂（托珠单抗）。此外，我们常规每周进行一次SARS CoV-2病毒载量PCR检测、SARS CoV-2抗体产生情况以及纤维化生物标志物检测，包括透明质酸(HA)和I型(PINP)及III型(PIIINP)前胶原氨基末端肽。

本研究旨在确定符合肺纤维化无创诊断标准的患者比例，这些标准包括：典型的CT扫描模式（网状影和/或支气管扩张），或血清PIIINP浓度升高超过16 µg/L，或支气管肺泡灌洗液（BAL）中PIIINP浓度升高超过9 µg/L。对于住院期间接受肺活检的患者，将根据肺部病理学结果确立肺纤维化的 definitive 诊断。我们将把诊断为肺纤维化的患者与无纤维化的患者进行比较，分别在机械通气患者群体和保持自主呼吸的患者群体中进行。主要终点将是第90天存活且无需呼吸机的天数（无呼吸机天数）。其他关注的结局包括机械通气持续时间、ICU住院时间、ICU死亡率、院内死亡率、第28天死亡率和第90天死亡率。本研究还旨在确定肺纤维化发生的危险因素，重点关注机械通气

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。