PRJNA1479635：FNR/ArcA-2,3丁二醇调控轴增强高产醇肺炎克雷伯菌葡萄糖摄取与adhE表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1479635

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数据说明

此前，我们发现肺炎克雷伯菌是一种高产酒精菌，其促进非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的发生发展。然而，其高产酒精的分子机制尚不清楚。通过比较肺炎克雷伯菌与大肠埃希菌的生物学表型，我们发现前者更擅长代谢高浓度葡萄糖，生长速度更快，且产生更高水平的酒精，其中2,3-丁二醇（2,3-BD）途径是导致这些差异的关键决定因素。更重要的是，具有2,3-BD途径的菌种——包括产气克雷伯菌、产酸克雷伯菌、阴沟肠杆菌和霍氏肠杆菌——均表现出与肺炎克雷伯菌相似的高产酒精能力，提示2,3-BD阳性肠杆菌科细菌中存在保守的酒精产生机制。敲除2,3-BD途径降低了磷酸转移酶系统（PTS）和酒精脱氢酶基因adhE的表达，而这些因子通常赋予增强的葡萄糖代谢和酒精产生能力。

通路缺失还下调了多种毒力决定因子，包括CPS、LPS以及1型和3型菌毛，从而在小鼠肺炎模型中减弱了毒力。此外，调控因子FNR通过上调adhE和2,3-BD通路基因增强乙醇产生，而ArcA以不依赖ArcB的方式激活2,3-BD通路，揭示了一种将代谢适应与毒力偶联的非经典信号机制。总之，我们的发现确定了FNR/ArcA-2,3-BD通路轴是驱动肺炎克雷伯菌高产乙醇的关键分子机制，突出表明2,3-BD通路是细菌代谢与毒力之间的关键纽带，也是控制肺炎克雷伯菌感染的潜在治疗靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。