PRJEB55816：大鼠急性呼吸窘迫综合征全转录组分析
该数据集来自 NCBI，为大鼠急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的全转录组分析数据，归入呼吸系统疾病/肺炎分类。源站描述指出 ARDS 是重症医学常见急危重症，ICU 患者中发病率约 10%，重症患者病死率超过 40%，但内源性 ARDS 急性肺损伤机制尚未完全阐明
基本信息
资源简介
PRJEB55816：大鼠急性呼吸窘迫综合征全转录组分析
PRJEB55816 是一项针对大鼠急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的全转录组分析数据集，来源于 NCBI，在本站归入呼吸系统疾病/肺炎分类。该数据集围绕 ARDS 这一重症医学领域常见的急危重症展开，借助全转录组层面的检测手段，为研究 ARDS 状态下基因表达的整体变化提供数据基础。ARDS 在重症监护病房患者中发病率较高，重症患者病死率突出，而内源性 ARDS 急性肺损伤的发生机制至今尚未被完全阐明，因此此类转录组数据对于探索疾病相关分子过程具有参考价值。数据集以大鼠为研究对象，主题标签为 Other，适合作为呼吸系统疾病尤其是 ARDS 相关研究的基础数据资源。
【数据集背景】
急性呼吸窘迫综合征是重症医学领域常见的急性危重症。国际流行病学 LUNG SAFE 研究显示，ICU 患者中 ARDS 的发病率约为 10%。近年来，严重急性呼吸道感染频繁发生并危害人类健康，例如 2003 年的严重急性呼吸综合征（SARS）、2009 年的甲型 H1N1 流感，以及仍在全球传播的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）。多数危重症患者会进展为 ARDS，病死率超过 40%。尽管过去 20 年在 ARDS 病理生理学的认识和治疗方面取得了显著进展，但内源性 ARDS 急性肺损伤的机制尚未被完全理解。该数据集正是在这一背景下，针对大鼠 ARDS 模型开展全转录组分析。
【数据内容】
该数据集为大鼠急性呼吸窘迫综合征的全转录组分析数据，英文名称为 Whole transcriptomic analysis in rat Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS)。其内容属于转录组层面的整体表达分析，主题标签为 Other。除上述全转录组分析这一性质外，源站未提供关于样本数量、分组设计、测序平台、具体基因或转录本列表等更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），编号为 PRJEB55816。研究对象为大鼠，数据类型为全转录组分析。关于样本采集的具体组织部位、时间点、实验条件以及测序与处理流程等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于呼吸系统疾病特别是 ARDS 相关的研究场景，例如从全转录组角度考察大鼠 ARDS 状态下基因表达的总体变化，为探索内源性 ARDS 急性肺损伤机制提供数据参考。结合其呼吸系统疾病/肺炎的分类，也可作为肺炎及急性肺损伤相关转录组研究的辅助数据。具体适用的分析类型与研究方向，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI 获取，编号为 PRJEB55816。关于数据下载方式、文件格式、预处理步骤、分析流程及配套工具等使用层面的信息，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于大鼠模型，其结论向人类 ARDS 的外推需谨慎。数据为全转录组分析，具体覆盖范围与测序深度等质量相关信息源站未提供。样本量、重复数、批次信息及潜在偏倚等限制因素，源站未提供。
【引用与许可】
数据来源为 NCBI，编号 PRJEB55816。关于引用方式、许可条款及使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJEB55816
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
急性呼吸窘迫综合征(ARDS)是重症医学领域常见的急危重症。一项国际流行病学LUNG SAFE研究显示，重症监护病房(ICU)患者中ARDS的发病率约为10%。近年来，危害人类健康的严重急性呼吸道感染频发，如2003年的严重急性呼吸综合征(SARS)、2009年的甲型H1N1流感以及新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease-19, COVID-19；后者仍在全球蔓延)。大多数危重症患者进展为ARDS，病死率超过40%。尽管过去20年在ARDS病理生理学的认识和治疗方面取得了显著进展，但内源性ARDS急性肺损伤的机制尚未完全阐明，且缺乏特异性生物标志物和有效治疗靶点。本研究采用RNA-seq技术研究脂多糖(LPS)诱导的内源性ARDS亚型肺损伤基因的表达谱，并筛选关键基因和通路。
本研究经南京医科大学连云港临床学院医学伦理委员会批准，所有动物实验均严格按照动物伦理要求执行（编号：KY20200311001，日期：2020年3月11日）。共选取12只健康清洁级雄性Sprague Dawley大鼠，年龄6-8周，体重230-250克。将大鼠随机分为空白对照组（N组）和实验组（LPS组），每组6只。通过向气道内滴注LPS（Sigma-Aldrich，美国；10 mg/kg）建立内源性ARDS肺损伤大鼠模型（LPS组）。36小时后，所有大鼠经腹腔注射甲苯噻嗪（Sigma-Aldrich，美国；8 mg/kg）和氯胺酮（恒瑞
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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