Covid-19 肺炎患者中的髓系细胞

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04590261

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：Covid-19；SARS-Cov2。SARS-Cov2感染在多数情况下会导致肺炎，其中30%需入住肺科病房，而这之中又有30%伴有严重急性呼吸综合征（SARS）的患者必须进入重症监护室，死亡率高。此感染引发强烈的细胞因子反应。在发展为SARS的患者中，发现了IFNα及响应IFNα的基因表达存在深刻且矛盾的缺陷。IFN是强效抗病毒蛋白，用于治疗病毒性肝炎。I型IFN，包括IFNα，几乎在每种细胞类型上都有普遍存在的受体。III型IFN，或称IFNλ，其受体表达更为局限，包括在中性粒细胞上。其多态性已与另一种经黏膜入侵的核糖核酸（RNA）病毒——丙型肝炎病毒（HCV）的预后相关，尤其是在非洲裔人群中。导致以往SARS-Cov或中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-Cov）疫情的冠状病毒会诱导IFN信号转导缺陷。许多其他病毒感染也会导致脱敏现象。

此外，IFNα本身可导致抗病毒反应缺陷。在免疫细胞层面，重症SARS-Cov2病例中观察到淋巴细胞减少，且中性粒细胞/淋巴细胞比例升高。通过表型和蛋白质组学研究，已鉴定出具有炎症或抑制功能的新中性粒细胞亚群。重要的是要了解：* 过度活跃或免疫抑制的髓系细胞分化是否由SARS-Cov2引起，并能否被特异性抑制；* 某些髓系亚群是否与疾病预后相关；* 髓系细胞是否具有SARS-Cov2的替代受体；* 某些IFN基因多态性是否与预后相关，并可能通过补充或抑制用于治疗。这些问题的答案将通过下述主要和次要结局指标来获得。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。