粪性腹膜炎与肺炎所致脓毒症患者微阵列转录组谱分析（验证队列）
该数据集来自 omicsdi.org，为脓毒症转录组研究的验证队列，包含因社区获得性肺炎或粪性腹膜炎入住英国重症监护病房的成年患者白细胞全局基因表达微阵列数据
基本信息
资源简介
粪性腹膜炎与肺炎所致脓毒症患者微阵列转录组谱分析（验证队列）
该数据集为一项脓毒症转录组研究的验证队列，来源于 omicsdi.org，归类于呼吸系统疾病 / 肺炎方向，主题标签为 Transcriptomics。其核心内容是对因社区获得性肺炎或粪性腹膜炎导致脓毒症、入住英国重症监护病房的成年患者进行白细胞全局基因表达微阵列检测，并在转录组数据无监督分析的基础上将样本划分至不同的脓毒症反应特征分组。该数据集旨在支持识别因粪性腹膜炎与肺炎所致脓毒症患者在转录组反应上的共享特征与差异特征，属于验证性队列数据，可与发现队列相互参照，用于考察脓毒症宿主反应的分组模式及其在不同感染来源之间的可比性。
【数据集背景】
脓毒症是重症监护领域的重要临床问题，不同感染来源所致脓毒症在宿主转录组层面是否存在共享的应答模式、又存在哪些特异的应答特征，是理解脓毒症异质性、探索分层策略的关键问题。该数据集正是围绕这一背景建立：以因社区获得性肺炎或粪性腹膜炎入住英国重症监护病房的成年脓毒症患者为对象，通过白细胞全局基因表达谱刻画其转录组反应，并借助无监督分析对样本进行脓毒症反应特征分组，从而为比较两类感染来源的共享与差异转录组特征提供验证性数据基础。
【数据内容】
数据内容为患者白细胞的全局基因表达微阵列数据，属于转录组学范畴。样本来自因社区获得性肺炎或粪性腹膜炎导致脓毒症的成年患者。除表达谱本身外，数据集还包含基于转录组数据无监督分析所得的脓毒症反应特征分组归属信息，即每个样本被指派到相应的脓毒症反应特征组。该数据集定位为验证队列，与同一研究框架下的发现队列相呼应。关于微阵列平台型号、探针数量、基因层面注释文件、分组的具体命名与数量、临床变量字段等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 omicsdi.org。样本采集对象为入住英国重症监护病房的成年患者，感染来源限定为社区获得性肺炎或粪性腹膜炎，且均符合脓毒症诊断。原始研究对前瞻性发现队列的 106 例成年患者进行了白细胞全局基因表达检测，本数据集为其验证队列部分。关于验证队列的具体样本量、采样时间点、样本处理与 RNA 制备流程、微阵列杂交与扫描实验方案、伦理审批与知情同意信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于脓毒症转录组反应的验证性研究，尤其是比较肺炎与粪性腹膜炎两类感染来源所致脓毒症在白细胞基因表达层面的共享特征与差异特征；也适用于检验或复现基于无监督分析得到的脓毒症反应特征分组方案，评估分组在不同感染来源患者中的分布与稳定性。此外，可作为转录组分层研究的参考数据，用于与发现队列或其他脓毒症队列进行交叉比较。关于该数据集在具体疾病标志物筛选、预后预测建模等方向的适用性，源站未提供明确说明。
【使用方法】
使用时应以白细胞全局基因表达微阵列数据为基础，结合样本的脓毒症反应特征分组信息开展分析；由于该数据集为验证队列，宜将其用于对发现队列所得分组方案或转录组特征的独立验证，而非单独用于特征发现。分析前需按微阵列数据的常规流程进行质控、归一化与基因注释，具体预处理参数与推荐流程源站未提供。关于数据下载方式、文件格式、访问入口与配套分析代码，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为验证队列，样本来源限定于英国重症监护病房的成年脓毒症患者，感染来源仅涵盖社区获得性肺炎与粪性腹膜炎两类，向其他人群、其他感染部位或非重症脓毒症的推广需谨慎。分组结果依赖对转录组数据的无监督分析，分组的具体定义与可重复性信息源站未提供。关于样本量、缺失数据、批次效应、平台间可比性及质量控制指标等，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始文献、DOI、数据许可协议与使用条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-5274
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们对一个前瞻性发现队列进行了白细胞全局基因表达检测，该队列包含106名因社区获得性肺炎或粪性腹膜炎所致脓毒症而入住英国重症监护病房的成年患者。在对转录组数据进行无监督分析后，我们将所有样本分配至脓毒症反应特征分组。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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