自身免疫背景相关间质性肺炎 miRNA 发现队列
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦伴有自身免疫背景的间质性肺炎(IP)患者的 miRNA 发现队列,属于呼吸系统疾病/肺炎分类,主题标签为 Genomics

基本信息
资源简介
自身免疫背景相关间质性肺炎 miRNA 发现队列
该数据集来自 omicsdi.org,聚焦伴有自身免疫背景的间质性肺炎(IP)患者的 miRNA 发现队列,属于呼吸系统疾病/肺炎分类,主题标签为 Genomics。数据按疾病病程、纤维化病变、IP 影像学模式(含 UIP、NSIP 等)、用力肺活量(FVC 相对参考值低于或高于 80%)及随访 24 个月内 FVC 下降 10% 的结局划分表型,样本富集于以肺部表现为主的初治患者。临床诊断涵盖 IPAF、SSc、RA、ARS 及 SSc/ARS 重叠病,未满足 IPAF 或明确结缔组织病标准者归为 uAIP。可用于识别临床亚组与疾病通路的 miRNA 特征研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们旨在识别间质性肺炎(IP)合并潜在自身免疫疾病患者的临床亚组与疾病通路的 miRNA 特征。表型依据疾病病程、纤维化疾病、IP 的影像学模式(包括 UIP、NSIP、其他)、用力肺活量(FVC:低于或高于参考值的 80%)以及结局(随访 24 个月内 FVC 下降 10%)进行划分。样本富集于以肺部表现为主的初治患者。临床诊断包括具有自身免疫特征的间质性肺炎(IPAF)、系统性硬化症(SSc)、类风湿关节炎(RA)、抗 tRNA 合成酶综合征(ARS)以及 SSc/ARS 重叠病。未满足 IPAF 或明确结缔组织病标准的患者被归类为未分化自身免疫性 IP(uAIP)。
【主题与分类】
主题标签:Genomics。本站分类:呼吸系统疾病/肺炎。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE290111
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源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE290111
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究旨在识别间质性肺炎(IP)合并潜在自身免疫性疾病患者的临床亚组及疾病通路的miRNA特征谱。表型依据疾病病程、纤维化疾病、IP的影像学模式(包括UIP、NSIP及其他)、用力肺活量(FVC:低于或高于参考值的80%)及结局(24个月随访期间FVC下降10%)进行分组。样本中富集了以肺部表现为主的初治患者。临床诊断包括具有自身免疫特征的间质性肺炎(IPAF)、系统性硬化症(SSc)、类风湿关节炎(RA)、抗氨酰tRNA合成酶综合征(ARS)及SSc/ARS重叠疾病。不符合IPAF或明确结缔组织病诊断标准的患者被归类为未分化自身免疫性间质性肺炎(uAIP)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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