gurmarin 抑制金黄色葡萄球菌生物膜形成

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-12154

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

金黄色葡萄球菌是一种机会性致病菌，能够引起从浅表皮肤感染到危及生命的严重疾病（包括肺炎和败血症）等多种感染。该细菌附着于生物和非生物表面，形成生物膜，对常规抗菌药物具有耐药性，并能逃避宿主防御的清除。与生物膜相关的感染可能导致住院时间延长、需要手术治疗，甚至可能导致死亡。能够抑制生物膜形成和毒力而不影响细菌生长的药物，可避免耐药性的产生，可能具有治疗价值。在这方面，我们从植物来源中鉴定并分离出一种小环肽——gurmarin，它能够抑制金黄色葡萄球菌生物膜的形成，而不影响该细菌的生长速率。我们测定了经gurmarin处理的金黄色葡萄球菌生物膜的基因表达，并将其与未处理的对照生物膜进行比较。我们鉴定了差异表达基因，并分析了它们在gurmarin抑制金黄色葡萄球菌生物膜中的作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。