HIV感染猕猴模型中磺胺甲噁唑生物转化通路的表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE87158

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

增效磺胺类抗生素，如甲氧苄啶/磺胺甲噁唑（复方磺胺甲噁唑或TMP/SMX），仍是治疗和预防HIV感染中耶氏肺孢子菌肺炎、弓形虫脑炎和等孢子球虫感染的首选药物（aidsinfo.nih.gov）。然而，与一般人群相比（发病率3%），HIV感染者对TMP/SMX发生迟发型超敏反应的风险显著增加（发病率20-57%）。典型表现为斑丘疹伴或不伴发热，且TMP/SMX是HIV感染者皮肤药物反应最常见的原因。在病情更严重的患者中，TMP/SMX还可导致血小板减少、肝毒性和大疱性皮肤疹。磺胺类超敏反应的风险随着艾滋病进展而增加，CD4+计数越低风险越高。这种风险至少部分归因于HIV感染中获得的SMX药物处置改变。我们假设HIV感染导致肝脏SMX解毒受损或SMX生物活化途径增强，这可能促成磺胺类超敏反应发生率增加。

我们利用感染SIVmac239的猕猴肝脏组织来探讨这一问题，该模型是公认的HIV感染模型。本研究旨在评估未接受药物治疗的SIV感染猕猴与性别、年龄相匹配的未感染对照组相比，肝脏中SMX生物转化通路的表达和活性差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。