肝细胞HNF4α缺陷经中性粒细胞依赖机制抵御肺炎链球菌脓毒症

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE345327

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症会诱导肝功能的深刻改变，从而促进疾病进展。我们此前已证明，腹腔脓毒症与肝脏转录程序的显著破坏相关，包括肝细胞核因子4α（HNF4α）的功能丧失，而HNF4α是肝脏身份与代谢的主调控因子。利用肝细胞特异性Hnf4a敲除小鼠，我们进一步表明HNF4α的缺失在腹腔脓毒症中具有不利影响。在此，我们研究了该反应在肺炎诱导的脓毒症中是否保守，并评估了其功能意义。肝脏批量RNA测序揭示，肝脏代谢通路和HNF4α靶基因的抑制是腹腔脓毒症和肺炎链球菌诱导的脓毒症的共同保守特征。出乎意料的是，肝细胞特异性HNF4α缺陷与肺炎球菌脓毒症期间较低的细菌负荷和更高的生存率相关。在机制上，这种保护作用依赖于中性粒细胞而非巨噬细胞。

这些发现表明，脓毒症诱导的肝脏HNF4α失调在不同感染病因中具有保守性，但对疾病结局的影响取决于具体情境。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。