多种肺部刺激诱导保守的单核细胞向巨噬细胞分化蓝图 [12和28天]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE320134

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺泡巨噬细胞（AM）构成了抵御肺部损伤的第一道防线。这些损伤常导致胎儿来源的组织驻留AM（fAM）被功能不同的单核细胞来源AM（mono-AM）所替代，从而对肺部免疫产生长期影响。然而，这些改变是保守性的还是损伤特异性的，目前尚不清楚。在此，我们展示呼吸道合胞病毒（RSV）感染会长期重塑AM区室。我们对RSV感染、流感（IAV）感染以及氯膦酸盐脂质体给药后的fAM和mono-AM进行比较分析，以推导出支配AM在不同损伤下功能与转录变化的规律。我们鉴定出CD11b+ mono-AM的一个关键组织整合检查点，该检查点涉及增殖能力的获得，并需要EGR2介导的转录重编程。

由RSV、流感或氯膦酸盐脂质体诱导的单核细胞来源肺泡巨噬细胞（mono-AMs），尽管在分化过程中处于显著不同的炎症环境，仍具有一种由个体发育决定的、固定不变的转录、代谢及增强免疫反应性的刻板特征；相应地，无论是由感染还是无菌性耗竭所诱导的mono-AMs，均能保护机体免受后续肺炎链球菌感染。相比之下，胚胎来源肺泡巨噬细胞（fAMs）则更易受微妙的、依赖于环境的转录改变影响。我们的研究结果强调，肺泡巨噬细胞区室的长期变化表现出起源依赖性的表型分歧，而mono-AMs的整合遵循一条由环境因素微调的固定轨迹。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。