内皮细胞通过染色质重塑保留炎症记忆 II

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE299261

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脓毒症幸存者表现出长期的内皮功能障碍，对肺炎等继发性感染的易感性增加。为探究内皮炎症记忆的表观遗传和转录基础，我们在体外双打击模型中，对暴露于序贯炎症刺激的原代人内皮细胞进行了转录组分析。IL-6预处理诱导了持续的转录重编程，并增强了对二次LPS刺激的反应性，提示存在记忆样状态。为从机制上剖析这一反应，我们在预处理阶段使用siRNA沉默AP-1转录因子JunB，并评估其在塑造炎症记忆反应中的作用。这些研究为维持内皮记忆的分子回路提供了见解，并确定JunB是该过程的潜在调控因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。