Trimodulin与肺炎RNAseq数据集
该数据集为RNAseq基因表达数据，来源于模拟危重社区获得性肺炎（CAP）并感染肺炎链球菌（S. pneumoniae）的复杂小鼠模型，用于评估trimodulin的治疗潜力，并探索trimodulin联合ampicillin在降低细菌负荷之外是否具有额外获益
基本信息
资源简介
Trimodulin与肺炎RNAseq数据集
GSE284045（Trimodulin and pneumonia）是一份来源于NCBI的RNAseq基因表达数据集，归类于呼吸系统疾病中的肺炎方向。该数据集围绕trimodulin在肺炎治疗中的潜在作用展开，所用模型为模拟危重社区获得性肺炎（CAP）并感染肺炎链球菌（S. pneumoniae）的复杂小鼠模型，通过基因表达谱评估trimodulin的治疗潜力，并进一步考察trimodulin与ampicillin联合使用时，在降低细菌负荷之外是否还能带来额外获益。数据集由Geraldine、Nouailles提交，发布时间为2024年12月11日，共包含1个文件，样例文件为GSE284045_series_matrix.txt.gz，主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台GPL24247以及物种编号10090。
【数据集背景】
社区获得性肺炎是呼吸系统疾病中的重要类型，危重患者常面临复杂的病理状态与治疗挑战。该数据集所依托的研究聚焦于trimodulin这一治疗候选物，在模拟危重CAP并感染肺炎链球菌的小鼠模型中考察其治疗潜力。研究设计还引入了trimodulin与ampicillin的联合方案，目的在于判断trimodulin是否能在降低细菌负荷之外提供额外获益，从而为肺炎治疗策略的评估提供基因表达层面的依据。
【数据内容】
该数据集属于RNAseq基因表达数据，主题标签为Expression profiling by high throughput sequencing，涉及平台GPL24247与物种编号10090。数据集文件数量为1，样例文件名为GSE284045_series_matrix.txt.gz，属于GZIP压缩格式的表达谱矩阵文件。数据内容围绕上述小鼠模型的基因表达谱展开，用于支撑trimodulin治疗潜力及联合用药额外获益的评估。
【采集与来源】
数据来源站为ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Trimodulin and pneumonia”。数据集作者为Geraldine、Nouailles，发布时间为2024年12月11日。数据基于模拟危重CAP并感染肺炎链球菌的复杂小鼠模型产生，采用高通量测序进行表达谱分析。其余采集细节源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于呼吸系统疾病尤其是肺炎相关的基因表达研究，可用于评估trimodulin在危重CAP小鼠模型中的治疗潜力，也可用于探索trimodulin与ampicillin联合应用时在降低细菌负荷之外的额外获益。对于关注肺炎链球菌感染模型、高通量表达谱分析以及联合用药机制的研究者，该数据集具有参考价值。
【使用方法】
使用时可下载数据文件GSE284045_series_matrix.txt.gz，按GZIP压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程，以保证数据读取与后续处理的准确性。
【质量与限制】
数据集文件数量为1，样例为系列矩阵文件，其余质量评估信息源站未提供。使用时应结合文件格式与字段核对结果判断数据适用性，源站未提供更详细的质量说明。
【引用与许可】
数据集作者为Geraldine、Nouailles，来源站为ncbi.nlm.nih.gov。许可信息源站未提供，引用时建议注明数据集编号GSE284045及来源站点。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE284045
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该RNAseq数据集通过评估基因表达，来评价trimodulin在模拟感染肺炎链球菌（S. pneumoniae）的危重社区获得性肺炎（CAP）患者的复杂小鼠模型中的治疗潜力。此外，我们将trimodulin与氨苄西林联合使用，以探讨trimodulin在降低细菌负荷之外是否还具有额外的益处。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
