MRSA与FTY720 S-膦酸酯对人肺内皮细胞H3K9乙酰化的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE274958

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数据说明

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）是导致重症肺炎和脓毒症的常见病因，可引发急性呼吸窘迫综合征（ARDS）。MRSA可引起肺内皮细胞（EC）功能障碍，这是肺损伤发病机制和进展中的关键步骤。我们既往研究已证实，1-磷酸鞘氨醇类似物FTY720 S-膦酸盐（Tysiponate，Tys）可改善MRSA诱导的肺内皮细胞活化及屏障破坏（PMID: 35015568）。为进一步推进对MRSA及Tys作用于肺内皮细胞机制的理解，我们研究了相关的表观遗传学改变。具体而言，我们研究了组蛋白赖氨酸乙酰化——这是一种核心的表观遗传修饰，与基因转录及内皮细胞对炎症刺激反应的功能调控相关。因此，我们测定了在存在或不存在Tys的情况下，MRSA暴露对肺内皮细胞组蛋白H3蛋白第9位赖氨酸残基乙酰化（H3K9ac）的影响，该修饰是一种与活跃启动子和基因激活相关的重要染色质修饰。

采用ChIP-seq分析对人类肺内皮细胞中H3K9ac表观遗传模式进行了无偏的全基因组分析。该分析识别出多个在内皮细胞暴露于MRSA±Tys时乙酰化靶向存在差异的基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。