TNFSF14驱动流感后肺泡巨噬细胞耗竭致继发性肺炎链球菌肺炎

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE273805

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

继发性细菌感染，通常由肺炎链球菌（Spn）引起，是甲型流感病毒（IAV）诱导的肺炎最常见且最严重的并发症之一。对IAV感染后肺部固有免疫景观的表型分析显示，在第7天组织驻留肺泡巨噬细胞（TR-AM）群体显著耗竭，这与对Spn增殖的易感性增加相关。为阐明TR-AM耗竭的分子机制并确定潜在治疗靶点，我们采用无偏倚方式，结合单细胞转录组学和细胞特异性PCR谱分析，利用IAV感染及IAV/Spn共感染的体内模型进行研究。TNF超家族14（TNFSF14）配体-受体轴被揭示为感染早期阶段流感后TR-AM死亡的驱动力，促使向肺炎链球菌性肺炎的转变，而经遗传修饰的TR-AM的肺内转移及抗体介导的特定通路组分中和减轻了疾病严重程度。

TNFSF14在重症病毒诱导的ARDS患者的支气管肺泡灌洗液（BALF）中高丰度表达，且主要表现为中性粒细胞表达，因而成为病毒所致肺损伤的新型决定因素。因此，靶向病毒感染肺内TNFSF14介导的细胞间通讯网络，可增强宿主防御、降低继发性细菌性肺炎风险并改善疾病结局。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。