ARDS中结合IFIH1解旋酶结构域的新型内源性dsRNA IBR1在LPS诱导的IFIH1激活及巨噬细胞M1极化中的作用
该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-seq表达谱文件,聚焦急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中LPS诱导的IFIH1激活与巨噬细胞M1极化机制
![GSE244502: IBR1: A Novel Endogenous dsRNA Binding to the Helicase Domain of IFIH1 and Its Role in LPS-induced IFIH1 Activation and Macrophage M1 Polarization in ARDS [RNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/142735.jpg)
基本信息
资源简介
ARDS中结合IFIH1解旋酶结构域的新型内源性dsRNA IBR1在LPS诱导的IFIH1激活及巨噬细胞M1极化中的作用
IBR1: A Novel Endogenous dsRNA Binding to the Helicase Domain of IFIH1 and Its Role in LPS-induced IFIH1 Activation and Macrophage M1 Polarization in ARDS [RNA-seq]
该数据集来自NCBI GEO,包含1个RNA-seq表达谱文件,聚焦急性呼吸窘迫综合征(ARDS)中LPS诱导的IFIH1激活与巨噬细胞M1极化机制。研究涉及新发现的內源性dsRNA转录本IBR1,其在单核细胞和巨噬细胞中受LPS及革兰阴性杆菌上调,并与IFIH1解旋酶域结合。数据可用于分析IFIH1相关信号通路及巨噬细胞极化相关的基因表达变化,为肺炎诱导ARDS的分子机制研究提供转录组层面的支持(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 02 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):由巨噬细胞和单核细胞驱动的失控炎症反应在持续肺损伤和急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的严重程度中起关键作用。先前的研究已确定IFIH1是肺炎诱导的ARDS中巨噬细胞M1极化的关键调节因子。IFIH1是一种胞质受体,负责识别病毒双链RNA(dsRNA)并激活炎症和抗病毒信号通路。有趣的是,我们的观察表明IFIH1也可以被脂多糖(LPS)激活,LPS是细菌细胞壁的一种成分。然而,LPS诱导IFIH1激活的确切分子机制仍不清楚。在我们的初步研究中,我们发现了一种新的转录本,命名为IFIH1结合RNA1(IBR1),它在单核细胞和巨噬细胞中受LPS和革兰阴性杆菌上调。我们已经确认
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL17021、10090。本站分类:呼吸系统疾病/肺炎。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE244502
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 10 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
由巨噬细胞和单核细胞驱动的失控炎症反应在持续加重肺损伤及急性呼吸窘迫综合征(ARDS)严重程度中发挥关键作用。既往研究已确定IFIH1是肺炎诱导的ARDS中巨噬细胞M1极化的关键调控因子。IFIH1是一种胞质受体,负责识别病毒双链RNA(dsRNA)并激活炎症和抗病毒信号通路。有趣的是,我们的观察表明IFIH1也可被脂多糖(LPS)激活,LPS是细菌细胞壁的组成成分。然而,LPS诱导IFIH1激活的精确分子机制尚不清楚。在初步研究中,我们发现了一种新型转录本,命名为IFIH1结合RNA1(IBR1),其在单核细胞和巨噬细胞中可被LPS和革兰阴性杆菌上调。我们已证实IBR1与IFIH1蛋白相互作用,形成复合物。进一步实验揭示,IBR1作为内源性dsRNA,因其局部双链结构而结合于IFIH1的解旋酶结构域。
这一特定相互作用构成了LPS诱导的IFIH1激活及随后ARDS中巨噬细胞M1极化的潜在分子机制。重要的是,我们的观察表明,在革兰阴性杆菌诱导的肺炎ARDS患者中,IBR1表达显著上调。了解驱动ARDS中IFIH1激活和巨噬细胞M1极化的分子机制,对于开发减轻肺部炎症和改善患者预后的新治疗策略具有重要意义。有必要进一步研究以阐明IBR1的确切作用及其作为ARDS治疗靶点的潜力。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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