MicroRNA-1在急性肺损伤中保护内皮

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE239928

标准获取流程：

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3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

急性肺损伤（ALI）及其最严重的形式——急性呼吸窘迫综合征（ARDS），会导致肺部严重的内皮功能障碍，且ARDS患者体内血管内皮生长因子（VEGF）水平升高。我们发现，受VEGF调控的一种微小RNA——microRNA-1（miR-1）的水平在急性损伤后的肺内皮中降低。在肺内皮细胞（EC）特异性过表达miR-1可在小鼠和人类模型中保护肺免受细胞死亡和屏障功能障碍的影响，并提高肺炎诱导的ALI后小鼠的存活率。MiR-1对肺内皮细胞及其他类型的内皮细胞具有内在的保护作用；它抑制凋亡和坏死性凋亡通路，并通过保护黏附连接和紧密连接来减少毛细血管渗漏。比较基因表达分析和RISC招募实验鉴定了损伤背景下miR-1的靶点，包括磷酸二酯酶5A（PDE5A）、血管生成素-2（ANGPT2）、激酶抑制因子Ras 3连接增强子（CNKSR3）和TNFα诱导蛋白2（TNFAIP2）。

我们在小鼠和人类内皮细胞中验证了miR-1对ANGPT2的调控作用，并在一个包含119名患者的肺炎队列中发现，miR-1与ANGPT2呈负相关。这些发现揭示了miR-1作为内皮细胞对急性损伤反应的新型细胞保护性协调因子的作用，具有预后和治疗潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。