肺炎克雷伯菌MS6671经PBT2与colistin处理的RNAseq转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE153553

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

耐碳青霉烯类且产超广谱β-内酰胺酶（ESBL）的细菌对多黏菌素耐药性的出现，对人类健康构成严重威胁，迫切需要新的治疗策略。在此，我们研究了对人体安全的离子载体PBT2恢复耐多黏菌素、产ESBL、耐碳青霉烯的革兰阴性人类病原体对抗生素敏感性的能力。观察到PBT2可使肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌、鲍曼不动杆菌和铜绿假单胞菌对最后防线多黏菌素类抗生素重新敏感，包括毒性较低的下一代多黏菌素衍生物FADDI-287。在含质粒携带mcr-1基因的耐多黏菌素大肠埃希菌或携带染色体mgrB突变的肺炎克雷伯菌中，我们未能筛选出对PBT2 + FADDI-287耐药的突变体。利用通过mgrB突变工程化获得多黏菌素耐药性的高侵袭性肺炎克雷伯菌菌株，我们成功证明了PBT2 + FADDI-287在体内治疗革兰阴性脓毒症的有效性。这些数据提供了一种新的治疗模式，用以打破高优先级耐多黏菌素革兰阴性病原体的抗生素耐药性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。