合成TLR4佐剂PHAD与E6020在小鼠腹腔巨噬细胞中的比较

数据比较两种合成TLR4佐剂PHAD与E6020在小鼠腹腔巨噬细胞中激活TLR4介导的先天免疫应答的能力,涉及MyD88依赖和TRIF依赖信号通路

geo
浏览 5
时间序列分类Expression profiling by arrayGPL2026610090疫苗编码
GSE131403: Comparison of synthetic TLR4 adjuvants PHAD and E6020 in mouse peritoneal macrophages

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

合成TLR4佐剂PHAD与E6020在小鼠腹腔巨噬细胞中的比较

Comparison of synthetic TLR4 adjuvants PHAD and E6020 in mouse peritoneal macrophages

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE131403_series_matrix.txt.gz),主题为表达谱芯片分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL20266。数据比较两种合成TLR4佐剂PHAD与E6020在小鼠腹腔巨噬细胞中激活TLR4介导的先天免疫应答的能力,涉及MyD88依赖和TRIF依赖信号通路。可用于研究TLR4信号通路、疫苗佐剂作用机制及先天免疫应答相关基因表达变化(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 17 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Toll样受体(TLRs)是一类模式识别受体,可结合微生物和宿主来源的分子,导致细胞内信号传导和宿主先天免疫应答的激活。TLR4的独特之处在于配体介导的激活启动两条信号级联:定位于细胞膜的MyD88依赖途径引发快速的MAP激酶和NF-κB激活,而定位于含TLR4内体的TRIF依赖途径导致IRF-3激活。先前的研究已将佐剂性与TRIF途径相关联。革兰氏阴性LPS是一种强效TLR4激动剂,结构相关的分子也以不同程度通过TLR4发出信号。在此,我们比较了两种先前用作疫苗佐剂的合成、无毒脂质A类似物——单磷酸酰脂质A(PHAD®,sMPL)和E6020——激活TLR4介导的先天免疫应答的能力。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL20266、10090。本站分类:呼吸系统疾病/肺炎。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE131403

【使用注意】

· 源站最后修改于 May 13 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE131403

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Toll样受体(TLRs)是一类模式识别受体家族,能够结合微生物来源和宿主来源的分子,进而触发细胞内信号传导并激活宿主先天免疫应答。TLR4的独特之处在于,配体介导的激活可启动两条信号级联通路:定位于细胞膜的MyD88依赖途径可快速引发MAP激酶和NF-κB的激活;而定位于含TLR4内体的TRIF依赖途径则导致IRF-3的激活。既往研究已将佐剂活性与TRIF途径相关联。革兰阴性菌LPS是一种强效的TLR4激动剂,结构相关的分子也可不同程度地通过TLR4进行信号传导。在本研究中,我们比较了两种此前用作疫苗佐剂的合成无毒脂质A类似物——单磷酸酰基脂质A(PHAD®,sMPL)和E6020——激活TLR4介导的先天免疫应答的能力。在原代小鼠巨噬细胞中,高剂量sMPL激活MyD88依赖信号传导的能力与E6020相当。与sMPL不同,E6020在所有检测剂量下均表现出对TRIF途径的强烈激活,包括TLR4内化和IRF-3依赖性转录。

Eritoran是一种TLR4/MD2拮抗剂,其对sMPL的竞争性抑制作用强于E6020。尽管存在这些差异,但在两个独立的小鼠免疫模型中,sMPL和E6020佐剂诱导的抗体应答水平相似,且Ig同型分布均衡。然而,在肺炎链球菌感染模型中,与sMPL相比,E6020诱导了更优的非特异性保护作用,这与活性氮和活性氧种类的激活相关。这些数据表明,TRIF偏向性并不一定预示更优的佐剂活性,但可能激活更强的抗感染天然防御。TLR4在TLR家族中较为独特,因为它同时激活MyD88依赖性和TRIF依赖性通路(综述见Takeda K和Akira S,2004,Semin Immunol)。为比较两种syn的 relative 刺激能力

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案