肺炎小鼠模型肺转录组图谱：人脂肪间充质干细胞或Prekallikrein处理

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE121970

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数据说明

成人间充质干细胞具有免疫调节作用，可能改善脓毒症期间的宿主反应。关于脂肪细胞来源间充质干细胞（ASCs）在脓毒症中作用的认识有限。肺炎克雷伯菌（K. pneumoniae）是革兰阴性肺炎和脓毒症的常见病因。本研究旨在确定人ASCs对小鼠肺炎性脓毒症期间宿主反应的影响。为此，通过气道感染肺炎克雷伯菌诱导小鼠肺部逐渐进展的感染，最终形成肺炎性脓毒症。感染后1小时或6小时，经静脉输注ASCs或赋形剂，分别于16小时或48小时后处死小鼠。比较了新鲜培养和冷冻保存的ASCs的效果，后者在临床上更具相关性。经静脉给药的ASCs在输注后1小时和3小时通过免疫染色在肺组织中可见，但15小时时不可见。尽管感染早期ASCs对细菌载量无影响或仅有适度影响，但在48小时时它们降低了肺部和远处器官的细菌负荷。

ASCs降低了肺部促炎细胞因子的水平并减轻了肺部病理变化，但未影响远端器官损伤。ASCs强烈改变了未感染小鼠和肺炎性脓毒症小鼠的肺部转录组，尤其影响。冷冻保存和培养的ASCs诱导的效果基本相似。这些数据表明，人ASCs在肺部诱导深刻的免疫调节效应，从而减少由常见人类病原体引起的肺炎性脓毒症期间的细菌负荷和肺部炎症，提示ASCs可能成为该病症的辅助治疗手段。实验分组定义如下：（1）plac_cryo，针对冷冻保存MSCs的安慰剂治疗且感染肺炎克雷伯菌的对照小鼠；（2）plac_cult，针对培养MSCs的安慰剂治疗且感染肺炎克雷伯菌的对照小鼠；（3）cryo，接受冷冻保存MSCs治疗的感染肺炎克雷伯菌小鼠；（4）cult，K.p

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。