659例重症COVID-19患者与534例无症状/轻症对照中I型IFN基因全部编码变异基因型计数

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Aaf23ab7be3fc078ebb7eb7c73ccd042e9606da705411072ce32cf6f29fcaaf2f

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

感染SARS-CoV-2后的临床结局从无症状感染到致死性COVID-19不等。我们发现，在659例危及生命的COVID-19肺炎患者中，相对于534例无症状或良性感染者，已知调控TLR3和IRF7依赖性I型干扰素（IFN）抗流感病毒免疫的13个人类基因座上，预测为功能丧失（LOF）的罕见变异存在富集。通过检测这13个基因座上的这些及其他罕见变异，我们在实验上确定了23例患者（3.5%）中的LOF变异，年龄17至77岁，构成常染色体隐性或显性缺陷的基础。我们显示，携带影响该通路的突变的人成纤维细胞对SARS-CoV-2易感。TLR3和IRF7依赖性I型IFN免疫的先天性错误可构成无既往严重感染患者危及生命COVID-19肺炎的基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。