肺炎克雷伯菌基因数据库

数据集获取

源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.12568637

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肺炎克雷伯菌是一种革兰氏阴性、兼性厌氧、无运动性的细菌，其自然栖息地为土壤环境。肺炎克雷伯菌也存在于人的口腔、皮肤和胃肠道中，当存在于肺部时是一种重要的病原体，可产生特征性痰液。该细菌与医院内感染有关，仍是深入研究的对象，其中一个相关研究主题是了解免疫功能低下患者可能如何受到该病原体的影响。本研究旨在基于从Genbank下载的注释基因组序列，提供肺炎克雷伯菌遗传组成的数据资源。该数据集包含肺炎克雷伯菌基因组中所有基因的基因名称、基因功能和基因序列，应可用于指导基因组编辑研究，以生成功能丧失突变体，从而理解这一重要病原体的致病机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。