烟曲霉暴露于肺炎克雷伯菌培养滤液抑制生长并刺激胶霉毒素产生

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD037833

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数据说明

烟曲霉是一种机会性肺部真菌病原体，可引起慢性和急性感染。该真菌与构成肺部微生物群的众多细菌相互作用，包括铜绿假单胞菌和肺炎克雷伯菌，二者均为囊性纤维化患者痰液中的常见分离菌。已有充分文献记载，细菌与真菌之间的相互作用既通过物理接触，也通过分泌产物的产生来实现，这些分泌产物可改变其他物种的生长和毒力。与铜绿假单胞菌的相互作用此前已被表征，表明在存在菌细胞的情况下真菌生长减少、胶霉毒素产生增加，而仅暴露于培养滤液时则相反。在我们的分析中，暴露于无细胞培养滤液抑制了真菌生长并增加了胶霉毒素的产生。蛋白质组学分析支持了这一结果，显示参与真菌发育的1,3-β-葡聚糖基转移酶（-3.97倍）、甲基甾醇单加氧酶erg25B（-2.9倍）和钙/钙调蛋白依赖性蛋白激酶（-4.2倍）均减少。

谷胱甘肽S-转移酶gliG（6.17倍）、非核糖体肽合成酶gliP（3.67倍）、O-甲基转移酶gliM（3.5倍）、γ-谷氨酰酰基转移酶gliK（2.89倍）及硫氧还蛋白还原酶gliT（2.33倍）表达升高，这些参与胶霉毒素产生的酶表达增加，提示可能向次级代谢转变。对细菌上清液的定性蛋白质组分析还阐明了这些变化的可能机制，包括外膜蛋白A、高亲和力锌摄取系统蛋白ZnuA和铁摄取系统组分EfeO通过物理相互作用降低必需营养素的可用性，包括周质丝氨酸内切蛋白酶DegP样在内的酶活性，以及包括烷基过氧化氢还原酶C在内的氧化还原活性蛋白。这些对真菌的蛋白质组改变可能对共感染背景下的毒力严重程度产生影响，并可能影

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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