支气管肺泡灌洗联合高通量测序技术

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07005466

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：肺炎。感染是免疫抑制宿主最常见的并发症，而肺部感染是免疫抑制宿主住院和死亡的主要原因之一，目前免疫抑制宿主肺炎的病原学准确诊断仍具有挑战性。支气管肺泡灌洗是下呼吸道微生物采样的标准方法，随着高通量测序（NGS）技术在病原学检测中的逐步应用及其成功，我们在临床上观察到支气管肺泡灌洗联合NGS提高了免疫抑制宿主肺炎的病原学诊断率，并使患者获益。

本项目拟前瞻性纳入免疫抑制宿主肺炎患者，同时进行支气管肺泡灌洗液NGS与临床常规痰培养、血培养、TB-DNA检测、真菌GM试验、病毒PCR检测及其他病原学检测，并基于上述结果，探讨支气管肺泡灌洗液联合NGS能否提高免疫抑制宿主肺炎的病原学诊断率，评估NGS作为肺炎检测与控制工具及优化免疫抑制宿主肺炎抗菌治疗策略的临床价值。本研究比较mNGS与CMT对免疫抑制宿主肺炎病原体检出的阳性率及准确率，探讨支气管肺泡灌洗液联合高通量测序技术在免疫抑制宿主肺炎精准诊断中的临床价值。以提高免疫抑制宿主肺炎的病原学诊断率，缩短诊断时间，改善其预后。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。